肠结核狭窄，腹痛可给予抗胆碱药或其他解痉药。伴有不完全性肠梗阻者，给予胃肠减压以减轻梗阻近端肠管的扩张与潜留。完全性肠梗阻，肠道大量出血经积极内科治疗仍未能满意止血者需要手术治疗。
要积极配合医生治疗，首先要消除症状，强调早期治疗早期病变是可逆的改善全身症状，可以促进病灶愈合。可以采用抗结核药物治疗，同时多注意休息，可以增强自身体质或者抵抗力，多吃新鲜水果蔬菜等。
肠结核阳性尽快去传染病医院进行抗结核治疗的。感染的可能性也相对较高。仍然需要隔离治疗。肠结核为消化系统结核中最常见者。绝大多数继发于肠外结核病，特别是空洞型肺结核。
首先是禁食一旦发现立即禁食，轻者5～10天重者10～15天或更长，腹胀明显时给予胃肠减压，禁食期间必须静脉补液，维持水电解质及酸碱平衡营养支持，可根据培养药敏选择抗生素来抗感染，对症治疗。
对于耶尔森菌肠炎，一般可以通过对症支持治疗，补充水和电解质，药物治疗等来治疗。
1、对症支持：在出现痢疾的时候不能吃东西，可以食用流食或者是半流食，或者是暂时不要喝奶类的东西，避免出现高渗的情况。如果病人出现了恶心和剧烈的腹痛症状，可以口服一些阿托类的药。
2、补充水分及电解质：轻度或严重脱水的病人，可以服用补充水分的补充；重度腹泻伴水、电解质紊乱、酸中毒、休克者等都可以进行输液治疗。另外，在补水的同时，应尽快进行静
3、药物治疗：可以口服氟喹诺酮类的药物，如：左氧氟沙星、环丙沙星等。
一旦确诊，立即禁饮食，一般需要禁食5-10天，腹胀明显的给予胃肠减压。静脉补充液体及维持营养，禁食期间必须静脉补液，维持水电解质及酸碱平衡。有肠穿孔，腹膜炎症状明显的经内科治疗无效者应积极行手术治疗。