上皮细胞常见于男性尿液中，正常人尿液中有时也能发现少数上皮细胞。如果有肾小球肾炎，尿液中会有更多的上皮细胞。如果肾小管有病变，就会有许多上皮细胞。有时会有许多阴道分泌物混入尿液。如果在常规尿液检查中只有上皮细胞值较高，并且尿蛋白和红细胞值正常，应该没有大问题，并且应该注意常规检查。
尿常规当中出现上皮细胞增高，是存在慢性尿路感染的表现，是由于急性的尿路感染没有治疗彻底或者存在耐药菌感染出现这样的问题的，需要通过进一步的检查，包括尿培养明确致病微生物的种类和药物敏感性以后，选择敏感的抗生素持续的治疗四周以上，才能够彻底的清除尿液当中的致病微生物，尿上皮细胞才会完全恢复正常。
通常提示尿液标本的污染，如包皮垢或者白带的污染。如果尿常规中非鳞状上皮细胞增多，同时尿中白细胞增高、亚硝酸盐阳性、尿中细菌成分增多，通常存在有泌尿系统的感染。
普通的尿常规检查中，无法检查尿鳞状细胞，需要病理科做尿沉渣涂片镜检。需要留取一定量的尿液，通常大约50-80ml左右。混匀后取5ml左右约4-6份，做离心沉淀后，取沉渣来涂片、染色。用显微镜来观察涂片中是否有鳞状上皮细胞及分布。还可以检查其他细胞，如抗酸杆菌，或者癌细胞，但一般都需要特殊染色处理涂片。
尿常规的检查时间，大多数选取清晨的第一泡尿，就是晨尿。选取是中段尿，排尿至一半时，再接取标本。排尿量要足一般在300ml以上，感到尿意明显时再接尿。留尿标本要在10ml以上。不建议患者从家中带来标本检查，主要是容器不能保证清洁，而且尿液存放时间长会产生一些化学反应，影响检查结果。女性在月经期间最好不要进行尿常规的检查。
