早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除，但是一般容易复发。如果囊肿逐渐长大后，挤压不破的情况下，可以根据自身情况，如果影响日常生活，可以到医院做手术切除囊肿，也是有一定的复发率。
肝囊肿消除可以通过手术来切除肝囊肿。肝囊肿在临床上也是非常常见的疾病，单纯的肝囊肿是先天性、非遗传性肝内囊性病变。出现这样的疾病，通常在很长一段时间里不会有明显的症状。
对于体表的囊肿，可以选择手术切除的方法，通常是在局部麻醉下进行手术操作，发生于甲状腺的囊肿，如果逐渐增大，会出现气管受压，病人也会出现吞咽食物时明显的不适感，可以选择开放手术，或者是进行射频消融治疗等，让囊肿逐渐萎缩。
较小的囊肿不适症状暂时不用治疗，较大的囊肿需要尽早手术，平时注意不要刺激囊肿部位，以免引起感染。囊肿是局部组织出现囊样变化，是与炎症，先天性发育，外伤，自身体质等多因素有关系，囊肿可以长在身体各个部位。
确定卵巢囊肿性质，首先通过B超发现卵巢囊肿回声，确定卵巢囊肿性质。如巧克力囊肿，属子宫内膜异位所致，可通过口服避孕药控制囊肿生长，如滤泡囊肿和黄体囊肿，无需通过药物治疗，经2-3个月正常月经周期可自行消除，若是直径＞5cm伴随肿瘤标志物不正常的卵巢囊肿，可通过手术切除进行相应治疗。
卵巢囊肿吃药一般不可去除，病理性的卵巢囊肿一般要考虑手术治疗。提起手术，大家都非常恐惧，其实现在针对卵巢囊肿的治疗，腹腔镜手术已经成为一个可以做到微创，恢复快捷的常规治疗方式。
