重度肾积水的治疗，首先要明确病因，针对病因治疗。肾输尿管结石导致的尿路梗阻，可以选择体外碎石或微创取石术。尿路畸形所导致的尿路狭窄一旦明确诊断，需要尽早手术治疗。还有中老年人常见的占位性病变，一旦明确诊断，也需要尽早手术治疗。
肾积水是一种很严重的疾病，如果得不到及时控制，会引发一系列的并发症。肾积水的主要是由于尿液从肾盂排出时受阻，导致肾内压力升高，肾盂肾盏扩张，肾实质的萎缩。多由结石、肿瘤、炎症等引起。
一般来说，肾结石并重度积水可以通过保守治疗、手术治疗等方式进行治疗。
肾结石是草酸钙等晶体物质在肾脏异常聚集所致，可引起腰部钝痛或剧烈疼痛，如果出现肾结石并重度积水的情况，患者应该进行全面的检查，明确肾脏的功能，可以在医生指导下选择腹腔镜下肾盂切开取石术或者是进行经皮肾镜碎石术。如果肾脏功能已经严重丧失，可以行肾切除手术。
患者日常应该规律作息，避免熬夜，注意休息，保持清淡饮食，避免食用辛辣刺激性食物。
双肾之积水为前列腺增生并发症之一，可进行手术处理。
前列腺增生后造成的排尿困难和梗阻越严重，小便越难，排尿时加上腹压，会出现膀胱代偿增后，久而久之，膀胱便有失代偿期的疼痛。在这个时期如果不能及时进行干预的话，很可能导致慢性前列腺炎或者前列腺癌等疾病发生。一旦发生代偿期，膀胱收缩力减弱后发生尿潴留，形成尿潴留后易造成下尿路梗阻，下尿路一旦梗阻以上可有肾盂积水，发生肾盂积水后，血液供应会发生紊乱，还会加重另一个副作用是肾功能不全，因此，前列腺增生病人，发生双肾严重积水时，必须住院治疗，必要时手术处理。
重度肾积水是能够治好的，肾积水大多是由肾结石或输尿管结石，肾脏畸形，肾脏囊肿，肾肿瘤，输尿管畸形狭窄，肾脏炎症感染等多种原因导致的肾盂积水造成的，这种病能够压迫肾脏，影响肾脏正常功能。
肾重度积水，常常是由于长期的尿路梗阻造成的。如果是单侧的肾重度积水，往往造成肾皮质变薄、肾功能丧失，此时可以行肾脏切除手术。由于另一侧肾脏还健在，所以可以完全代偿，机体不会出现太大的影响。如果是由于各种原因造成双侧的肾脏严重积水，并且双侧的肾脏功能丧失，此时病人通常处于肾衰竭的状态，需要紧急的行透析治疗。