霉菌性阴道炎首先要配合敏感的抗菌素局部用药治疗，用药的种类比较多。局部使用都可以针对性地治疗。也可以配合一定的药物阴道栓剂每日局部用药，每天1到2次，连续用两周，日常注意保持外阴的卫生。
在此期间不要同房，也是不要吃一些辣性的食物，不利于治疗和恢复，同时也是需要注意个人的卫生，坚持治疗，以免引起复发的情况，也是需要做好复查来确定恢复的情况。霉菌性阴道炎的情况可以选择用苏打水来进行冲洗，同时要选择局部用制菌霉素栓剂来进行治疗。
霉菌性阴道炎治疗要先去除诱发因素，减轻症状，改变阴道的酸碱度，才能有比较好的治疗效果。然后根据不同的情况选择用药，但是禁止使用抗生素，同时要注意个人卫生，选择棉质的内裤，并用开水烫洗，治疗时疗程要足，以免产生耐药性。
霉菌性阴道炎的治疗以阴道用药为主，同时可以配合口服药物治疗。临床中常选用的药物有克霉唑、盐酸特比萘芬阴道泡腾片儿、硝呋太尔、氟康唑，孕期可以选择的药物主要是克霉唑和硝呋太尔。用具体用药方法为：除了克霉唑三天使用一次，其他的阴道塞药都是每天一次，连用七天，要求性伴侣同时治疗。
一般情况下，女性如果感染了霉菌性阴道炎，在月经期间可以用口服药物，但是不能外用药。
女性感染了霉菌性阴道炎可能是不注意个人卫生导致的，女性在来月经期间可以用氟康唑胶囊这种口服药物进行治疗，有助于控制霉菌感染。但是在月经期间不能够用硝酸咪康唑栓、克霉唑栓等外用药进行阴道给药治疗，否则容易被月经血冲出阴道，这不利于阴道对药的吸收，从而达不到治疗的效果。
支原体感染和霉菌性阴道炎同时发作是可以治疗的，应先到妇科进行详细的检查，支原体感染可以通过药物敏感性再选择其药物，并且俩种病的药物是不可以相冲的，这样的疗效才会更好，一般采用口服或输液治疗，而霉菌性阴道炎一般是使用内部药物。
