妇科衣原体可以通过药物治疗、生活护理等方式来治疗。
患者感染衣原体，可能会引发生殖器出现感染，患者可以在医生的指导下使用阿奇霉素、红霉素或四环素等药物进行治疗，平时还需要注意卫生，保持良好的卫生习惯。并且在治疗期间，避免发生性行为，以免出现交叉感染的情况。同时，伴侣也可以一同进行治疗。
一般情况下，小孩衣原体肺炎主要是用大环内酯类药物进行治疗。
如果咳嗽咳痰并且伴有发烧症状，建议还是静脉输液治疗，主要是用大环内酯类药物进行治疗，常用药物有阿奇霉素、克拉霉素等。同时，患儿同时可有发热等伴随症状，需给予对乙酰氨基酚、布洛芬等药物进行对症处理，多吃一些新鲜的瓜果和蔬菜，避免烟雾和寒凉刺激。
女性衣原体支原体可以通过以下方式进行治疗：
女性衣原体支原体可以通过中药治疗。也可以进行理疗，能够迅速缓解症状，控制炎症的发展。并且患者平时要少吃一些辛辣的东西，多吃一些清淡的东西，比如酒、海鲜、韭菜、羊肉等，多吃一些发物。建议到正规的公立医院进行详细的检查和处理。
女性支原体、衣原体可以通过药物进行治疗。
妇科支原体、衣原体感染一般都是用一定量的抗生素进行治疗，一般情况下可以将其分离出来，然后进行药物敏感性测试，以确定哪些抗生素比较敏感，然后进行相应的治疗。常用的抗生素有红霉素、阿奇霉素等。对于支原体、衣原体等，一般不能使用其他的广谱抗生素。
男性衣原体感染可以通过生活护理、药物治疗等方式进行改善。
在感染的时候，要多吃一些清淡的食物，不要喝酒，不要受凉，不要熬夜。盐酸多西环素片、阿奇霉素片等是目前比较常见的药物。尿路炎症是一种常见的疾病，表现为尿路发炎，会有尿灼热、排尿时的刺痛感，尿路的分泌物会增加，尿路的分泌物也会变得很淡。早上起床后会发现尿道有大量的白色分泌物阻塞，同时可以发现里面有大量的白色的分泌物，需要及时就诊。
一般情况下，怀孕后支原体、衣原体感染可以在医生的指导下服用大环内酯类药物治疗，比如：阿奇霉素。
支原体、衣原体感染可以经胎盘垂直传播或逆行性感染，引起宫内感染，可导致流产、早产、胎儿宫内发育迟缓等，小孩出生时可能会导致感染，出现结膜炎等。对于孕期的特殊感染，除了支原体、衣原体，还有弓形体、巨细胞病毒、风疹病毒等。这些特殊感染可能会造成胎儿畸形，要及时筛查，及时处理。
