一般采取侧卧方式进行卧床休息，减少对切口的压力及挤压造成出血。卧床休息时间取决于伤口的恢复程度。合理的膳食安排术后一般以清淡饮食为主在术后的一个月内尽量避免食用辛辣刺激之品，以免刺激切口造成炎症反应。也要注意确保事物的干净卫生，避免因是要不洁的食物而造成腹泻，从而导致切口感染。
肛瘘术后可能发生尿潴留，要锻炼排尿功能。手术后要每天换药，按时拆线，保持伤口清洁，避免伤口周围积脓影响恢复，导致伤口感染，不能愈合。尽量每天清洗肛门，更换内裤。手术之后要少活动，多休息。
肛瘘治疗术后需注意系统常规的换药及护理。大便之后，要用中药坐浴，消毒液的清洗、冲洗；定期到医院换药；后期采用促进伤口生长的药膏，涂抹在创面上，使创面能够达到非常良好的愈合。
应保持肛门部清洁，久坐后应间断站起来走走，要保持大便通畅。平时饮食要清淡，不要吃一些辛辣刺激的食物，不要酗酒，熬夜和抽烟。避免粗糙干硬的粪便对伤口的刺激，减轻疼痛可多食一些高蛋白、富有营养的食物，如吃一些紫菜、海带等。
肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
