牙根尖囊肿手术没有什么风险的，牙根尖囊肿是由根尖肉芽肿或者是慢性牙槽脓肿发展而来的一种牙科疾病，会出现局部肿胀、疼痛等症状，如果囊肿较大，可以进行手术切除，是一种很简单的手术。
根尖脓肿指根尖周围的牙周膜和牙槽骨等尖周组织的疾病。疼痛非常剧烈，呈持续性、搏动性。治疗方法：可以根管治疗，也可切开引流。根尖囊肿由根尖肉芽肿发展而来，也可能是慢性牙槽脓肿发展而来，多无自觉症状。治疗方法：手术切除。不论是根尖囊肿还是根尖脓肿，要想彻底治疗，都得进行手术。
牙根尖囊肿要到正规医院拍摄根尖片或者曲面断层片，确定是哪个牙，囊肿有多大，边缘到哪，然后再确定进一步的治疗方案。一般根尖囊肿需要进行手术治疗，如果囊肿比较大，边缘已经达到牙槽突的顶部，牙齿已经出现松动，这时需要拔除根尖囊肿的牙齿，然后把根尖部的囊肿完整摘除。如果囊肿不大，仅限于根尖区，可以先进行根管治疗，然后进行手术切除囊肿和囊肿附着内的根尖部分，再进行根尖的倒根充，这样就可以治愈。
根尖囊肿如果发生肿痛现象，多数是属于慢性牙槽囊肿发炎的症状。这种炎症如果不及时治疗，有可能炎症加重后会引起牙髓炎，而且也极有可能会引起牙槽骨的脓肿加重。建议及早就诊，早些治疗。
牙根尖囊肿不会癌变的，口腔部位的病变恢复相对来说不是很快，食物的反复刺激，会有影响恢复，牙齿的根尖囊肿都是由慢性炎症刺激导致的。可以拍张口腔牙齿的全景片，看看这颗牙齿的根尖囊肿大不大，在选择做根尖切除术。
根尖囊肿如不接受治疗无法自愈，牙根尖周围软组织和硬组织会受到破坏，甚至影响邻近牙齿的牙根尖，导致牙齿根尖出现吸收，或出现牙槽骨、颌骨的空腔，形成瘘道，使得根尖脓包经久不愈，可引起急性症状发作。
