牙齿矫正的坏处主要是有可能导致牙槽骨发生吸收，形成人为的牙周病，也可能会产正畸性牙龈炎或者是牙周炎，因为正畸需要移动牙齿及牙根，在移动过程中可能会使周围牙槽骨吸收。
牙齿矫正是没有危害的，但如果医生操作不规范，或者矫正后没有护理好，还是有影响的。牙齿矫正的周期很长（通常带矫治器和保持器约需2～3年），长期带矫治器，必然会引起牙龈的排斥反应，导致出现牙周炎及牙龈萎缩的后遗症。
矫正牙齿根据矫正方案和过程不同，价格一般在20000-50000元。矫正牙齿需要佩戴矫正效果保持器。而矫正器分为普通矫正器和隐形矫正器。普通矫正器价格在8200-11000元左右。隐形矫正器国产的35000元左右，进口的52000元左右。现在牙齿矫正一般需要先拍口腔全景片及头颅侧位片，大概需要2000元左右。矫正牙齿一般需要2年左右的时间，在这期间，需要按时复诊复查，根据牙齿变动的情况，调整矫正的力量及方向。这中间花费大约在6000-9000元之间。
正畸医生会根据患者的需求，制定出一套适合的治疗方案并采集牙齿印模拍摄牙齿照片。然后是制定矫正计划，量齿定做无托槽隐形矫治器。之后就是佩戴矫治器，除了吃饭和刷牙，其他时间都要佩戴。每两周左右更换一副牙套，每两个月去医院复诊一次。最后矫正完成，摘下牙套。
牙齿矫正的过程中有各种副作用，对口腔卫生不好，牙齿上面粘的托槽周围容易引起牙菌斑滞留，时间久了容易引起牙龈炎。需要好好刷牙，控制牙菌斑。金属托槽也容易会导致口腔粘膜的创伤性溃疡，应该注意必要时使用正畸蜡保护。牙齿矫正的过程中，为了使牙齿移动，在牙齿上面施加外力，如果力量过大会引起牙根的内外吸收。
