通常来说，先天性黄疸是通过药物治疗的。
体内胆固醇水平明显偏高会导致新生儿出现黄疸，新生儿出现黄疸一般使用益生菌、茵栀黄口服液等药物进行治疗。益生菌可以有效调节儿童的肠道菌群，茵栀黄口服液可以有效的减少胆红素的肝肠循环。药物治疗可以很好地降低新生儿的先天性黄疸水平。如果先天性黄疸使用药物治疗无效，可能还要考虑手术治疗。
得了先天性癫痫病尽早要去医院检查治疗，一般采取中西医结合治疗在医生指导下口服抗癫痫药物治疗，日常生活中应持乐观态度，树立战胜疾病的信心。多吃富有营养、易于消化的食物，如面食、豆类、瘦肉、鸡蛋、鱼、牛奶等，尤其应多食用豆类、新鲜蔬菜、水果、乳制品，这些含高蛋白质和含磷脂丰富的食品，有助于脑功能的恢复，同时减少癫痫发作次数。
对于先天性心脏病，最好的治疗方法就是进行外科手术。比如主动脉瓣狭窄、肺动脉瓣狭窄、主动脉收缩等。如果能得到及时的外科治疗，那么治愈率就会很高。先天性心脏病经解剖学处理后，可使其恢复正常。如果患者有先天性心脏病，那么就可以恢复到正常人的生活方式和生活品质。对于先天性心脏病，尽早诊断和治疗是非常重要的手段。
先天性鼻泪管阻塞治疗可以用热敷按摩泪囊区，也可以用滴眼液。如果半年后不能恢复，需要及时手术。是儿童常见疾病。大多数孩子可以在2到3个月的时候自动通开它，这种疾病会导致儿童流泪并增加眼睛分泌物。
先天性囊肿的治疗，要看囊肿的具体位置和，如果位置不重要，对人没有影响是不用治疗的。而如果位置比较重要，对人的健康产生影响，可以通过手术切除，所以具体要看囊肿的位置。
