卵巢囊肿3.6毫米，是比较严重的，建议避免剧烈的活动，以免引起卵巢蒂扭转，从而导致剧烈的疼痛，注意复查妇科彩超，然后达到手术指证后，进行手术切除，放松心态，不要过度的紧张和焦虑。
卵巢囊肿已经有49mm大小了。卵巢囊肿的治疗原则是在5厘米以下可以观察到。超过5厘米的进行外科治疗。卵巢囊肿可引起排卵异常和月经不调。积极治疗。手术切除是主要的治疗方法。采用腹腔镜手术。
卵巢囊肿一般都是由于有附件的炎症，或者是有子宫内膜异位症导致的。中医来讲，是由于卵巢周围有寒湿，血瘀导致的，所以治疗起来一般都是活血化瘀，祛寒湿。另外遗传性加上饮食不当，内分泌失调，也有可能引起卵巢囊肿。
5厘米的卵巢囊肿，不算是很大。
不过也有可能会发生一些并发症，比如扭转、破裂或者感染等。如果之前没有发现过这种情况，可以在月经干净以后再复查一下B超。如果消失了，说明这是生理性的黄体囊肿，不用治疗。如果囊肿经过彩超检查发现囊肿内有乳头状突起，并且伴有丰富的血流信号，此时行肿瘤标志物检查，发现肿瘤标志物明显升高，考虑囊肿可能有恶变的可能，这时需要行手术干预。
通常情况下，卵巢囊肿61mm的患者可以通过手术治疗、日常护理等方式进行治疗。具体情况分析如下：
1.手术治疗：卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，免疫力下降、感染、吸烟、电离辐射等因素都有可能会导致卵巢囊肿，患者可能会出现坠胀、下腹部不适、月经异常等症状，由于卵巢囊肿61mm的患者使用药物并不能得到较好的治疗效果，患者可以通过卵巢囊肿切除术、附件切除术、子宫切除术等方式进行治疗。
2.日常护理：患者配合医生进行治疗时，平时应注意个人卫生，保持私处的清洁、干燥，早睡早起，还可以适当的进行运动，促进身体恢复的同时，还能提高患者免疫力。