自身免疫性疾病会出现多次靶器官受累，易损害中枢神经系统。如果自身免疫存在问题，需要调节免疫功能，必要时加用免疫抑制剂。脑炎治疗方案需要神经内科医生在评估病情后予以制定。需要消炎、降颅压。脑炎会有后遗症的。
通常海扶手术后没有明显后遗症，而利普刀锥切宫颈手术后可能有后遗症。宫颈糜烂导致同房后出血、白带异常，在阴道局部塞药，进行保守治疗的效果一般，但没有生育需求，可以通过手术治疗，主要是利普刀手术和海扶术。通常海扶手术后没有明显后遗症，海扶刀只是祛除宫颈表面的糜烂，在宫颈局部不会留瘢痕。而利普刀锥切宫颈手术后可能有后遗症，主要因为瘢痕组织弹性减小，会影响女性怀孕，还可能出现经血排出困难导致痛经，还可能影响顺产。
甲亢突眼手术有后遗症。
甲亢又称甲状腺功能亢进症，本病多发于二十至四十岁妇女，属内分泌科常见病。一般情况下，甲亢可以导致一些严重的并发症，甚至会危及生命。甲亢患者病症多样，在这些症状中，非常典型的是突眼，突眼亦为甲亢的特征性表现。甲亢的临床表现为双眼视力突然下降或消失，眼球运动障碍以及复视等症状。甲亢突眼在临床上分2种，一为单纯性突眼，二为恶性浸润性突眼。对于单纯性突眼可以选择保守治疗，但是对于恶性浸润性突眼病必须进行积极地外科手术才能够有效缓解病情。恶性浸润性突眼与甲状腺本身免疫功能紊乱有关，所以这类突眼，很多时候都要做手术。
肥胖患者术后出现的后遗症有很多，比如大出血，吻合口狭窄，肠梗阻等。
所有的手术都会有合并症，因此，无论是对于外科医师还是病人来说，都会引起很大的重视。出血、吻合口漏等是短期的并发症，还有一些患者会出现创面的炎症和肺部的炎症。目前，由于胃囊切除和胃部的手术，长期的合并症是很少见的。而胃食管逆流是胃囊肿手术中最常见的一种合并症。另外，由于手术中的营养吸收不足，会造成严重的贫血。
一般情况下，患者做了巨结肠手术之后可能会有以下后遗症，具体内容如下：
1、初期的后遗症是小肠结肠炎症，这种情况很严重，术后初期和恢复期间都有一定的几率，一旦发病就会导致感染性休克。
2、术后会有腹腔感染、肠管感染、发热等症状，术后还会有肛门位置的问题，一旦发现有任何不正常的症状要立即去医院就诊。
多饮水，多食用蔬菜、水果，饮食中适当增加纤维素等，以预防便秘的发生。
一般来说，包茎手术没有明显的后遗症。
出血、感染、疼痛等症状是包茎手术的主要风险，不过大多数情况下，术后1周左右就能改善。除了瘢痕体质的患者，可能会在手术切口部位出现不同程度的瘢痕外，包茎手术无其他明显的后遗症。建议患者在术后要注意饮食，不要食用生冷、辛辣等食物，多吃新鲜的蔬菜和水果，注意避免剧烈运动，多休息，有利于身体恢复。
