亚急性甲状腺炎的治疗方法主要是对症治疗。
急性甲状腺炎是一种自身局限性疾病，主要表现为发热、甲状腺痛，经过一定的病程病情逐渐自行缓解。患者需要充分休息，如甲状腺痛明显可给予非甾体抗炎药止痛。如果发热体温在38以上，可以给予退烧药。发热、甲状腺痛症状严重，患者无法耐受，可接受糖皮质激素治疗。使用糖皮质激素可以迅速缓解症状，减轻亚甲蓝症状。但糖皮质激素有一定的不良反应，激素在早期停药后病情反复，必须谨慎使用糖皮质激素。
急性甲状腺炎穿刺后是需要验血的。安全的穿刺多可以明确，目前甲状腺炎是哪一种导致的，及时进行血液的检查进一步的了解目前甲功情况，可以用来判断是甲亢期还是甲减期，再进行针对性治疗。
亚急性甲状腺2~4月就可以治疗好，而自身免疫性甲状腺炎，要根据病情来决定治疗时间的长短，轻微的自身免疫性甲状腺炎一般4~6周就可以缓解症状，如果有甲状腺毒症或甲减，则需要较长时间的治疗。
亚急性甲状腺炎有多种治疗措施，临床治疗通常是使用抗炎药、退烧药，若发热持续不退则需要使用糖皮质激素进行治疗，但在进行激素治疗前应评价患者是否适合激素治疗。具体治疗措施应由医生面诊后，根据患者情况给出详细的治疗方案。
亚急性甲状腺炎患者症状主要如下：
1、疼痛：最突出表现为颈部甲状腺区域疼痛，而且疼痛最严重的地方通常会触诊到一个结节，这个结节在触诊到的触感下质地坚硬接触时会感到压痛，亚急性甲状腺炎除了颈部疼痛外还有患者出现牙根、耳后、头部等放射痛。
2、发热：亚急性甲状腺炎在病情较严重时部分患者又出现发热症状，发热时间一般在傍晚以后且部分患者可表现高热情况急性甲状腺炎可进行甲状腺功能和甲状腺碘摄取率检测，表现为典型的分离现象同时血沉水平明显升高，对亚急性甲状腺炎一般应使用非甾体抗炎药或添加糖皮质激素治疗。
亚急性甲状腺炎有多种治疗措施，包括硫脲类药、促甲状腺激素及抑制剂量的甲状腺激素。采用这些药物影响疾病过程的证据，尚不能令人认同。对本病无特殊治疗。肾上腺糖类皮质激素对本病有显著效果，用药1～2天内发热和甲状腺疼痛往往迅速缓解，一周后甲状腺常显著缩小。