结石在肾盂肾盏中，这时产生疼痛的部位就是在肾脏中。结石的部位在输尿管中，如果卡压在输尿管的情况下，就会引起腰部中段的疼痛。结石在膀胱内，一般是不会引起疼痛的状况。
可以应用止痛解惊的药物，疼痛产生主要是由于泌尿结石造成梗阻，造成输尿管的梗阻，梗阻形成产生疼痛。需要解除梗阻，可以通过体外碎石、切割弹道碎石，以及钬激光、绿激光等手术的方法。
尿结石疼痛的缓解可以采取抗炎、解痉、止痛、手术和碱化尿液等。尿结石疼痛有相当一部分原因是由感染引起，这时可以取尿液做中段尿液培养加药敏试验以及尿液分析。如果尿液分析提示有白细胞或者细菌，则提示存在细菌感染，一般可以根据药敏结果使用相应的抗生素治疗。如果是结石引发的严重梗阻，则需要行手术治疗。
尿结石要大量的吃水果和蔬菜，适当增加含膳食纤维的食物。禁食菠菜等富含草酸的蔬菜，可以食用木耳，香菇，豆芽，海带，莲菜等。一般认为避免过多的食用含草酸的食物，比如甘蓝、杏仁、花生、甜菜、欧芹、菠菜、大黄、红茶。
尿路结石经常会在晚上发作，表现的临床症状是腰腹部剧烈疼痛。这种疼痛有时候是比较剧烈的，导致不能够进一步的睡觉。因为在晚上的时候全身处于放松状态，这时候迷走神经是比较活跃。
