严重的子宫内膜异位症可以采用药物治疗或手术治疗，减灭和去除病灶，缓解和消除疼痛，减少和避免复发。常用的药物治疗有口服孕激素类药物的假孕疗法和假绝经疗法等，而手术治疗需要根据病人的年龄和有无生育要求来确定手术方式。
痛经不一定是子宫内膜异位，但是子宫内膜异位会表现出痛经的症状。
痛经有原发性和继发性两种类型，常见的痛经与子宫发育不良、内分泌紊乱有关。由子宫内膜异位引起的痛经主要是继发痛经，并且会越来越严重，因此痛经可能是子宫内膜异位的临床表现，可以通过医生的诊断来确定，并对症进行治疗。
日常要注意休息，避免过度劳累，避免熬夜，以免导致症状加重。
通常情况下，子宫内膜异位症是由经血逆流、淋巴扩散等造成的，可以通过药物治疗、手术治疗等来治疗。具体分析如下：
子宫异位症是由于多种因素造成的，首先经血逆流导致子宫的上皮细胞进入到输卵管或者卵巢附近持续生长，就会产生子宫内膜异位。此外和淋巴的扩散以及静脉的扩散有很大的关系，子宫上皮细胞随着淋巴和静脉转移到身体的其他部位就会出现子宫的异位。此外还有一些医源性的种植，例如在剖宫产手术以后也会出现卵巢和输卵管的子宫异位。患者可以口服炔诺孕酮片治疗，也可以选择一些中药来进行调理，例如桂枝茯苓丸、血府逐瘀胶囊等等。如果症状持续加重，需要考虑进行手术治疗。
药物治疗：年轻的女性有痛经，查体，盆腔无明显包块，给予短效的口服避孕类的药；手术与药物联合治疗：手术治疗前给予3-6个月的药物治疗，使异位病灶缩小、软化，有利于缩小手术范围和手术操作。对保守性手术、手术不彻底或术后疼痛不缓解者，术后给予药物治疗，推迟复发。
保留卵巢功能手术：切除盆腔内病灶及子宫，保留至少一侧或部分卵巢。适用于III、IV期患者、症状明显且无生育要求的45岁以下患者。腹腔镜手术治疗，年轻的女性有生育要求或盆腔检查，卵巢包块较大，建议采用腹腔镜手术，保留正常的卵巢功能。
子宫内膜异位症痛经以继发性为主，而且呈进行性加重。研究表明引起子宫内膜异位的疼痛与神经纤维的异常分布有关。内异症病人的血清、腹腔积液中，前列腺素的升高水平与疼痛程度呈正相关。
