过度肥胖的话，可能会影响到正常的生殖器发育。控制一下孩子的饮食，是不错的，做到有规律的饮食，不能任由孩子想吃多少就吃多少，可选用少吃多餐，不要暴饮暴食。可多吃蔬菜水果。可适当锻炼，控制孩子饮食，不要吃肥肉，油炸食物等，以免加重肥胖。
生殖器短小也许是因为肥胖造成的，可以通过减肥来进行治疗，如果减肥以后阴茎还是发育短小，孩子还小，可以通过补充雄性激素来促进阴茎的发育。平时注意适当锻炼。可以吃一些热量比较低的食物。
儿童的肥胖与摄入过量的高脂食品有关，一般认为是由于某种疾病引起的，比如：垂体瘤，肾上腺皮质功能亢进，肾上腺皮质瘤等。
因此需要进行头颅ct，肾上腺的ct检查，还有血液检查、血压，可以通过测量血压来判断患儿有无血压，抽血检查可以检查患儿的血脂、空腹血糖、空腹胰岛素、餐后两个小时的血糖，从而明确病因，并进行相应的处理。
肥胖症是多基因的遗传。肥胖是一种非遗传性的疾病，其原因不明，可能与遗传、环境等因素相关。肥胖是一种家族遗传的疾病，这与家庭成员的不良生活习惯有关。肥胖有家族性聚合性，但其基因基础尚未明确。同时，也不能排除一些人有共同的饮食和运动习惯，肥胖是由基因决定的。肥胖病人应该采取措施减肥，比如可以通过节食和锻炼减肥。
肥胖症主要由两方面因素引起。外界环境如天气变化，气候突变，运动不足等都可能引起肥胖。一点就是外部因素，即饮食过多，以及活动太少造成的，二是内部因素。其中最重要的一个影响就是神经系统和消化系统功能紊乱，使食欲减退，从而引起体重增长。内部因素主要有遗传因素，人类单纯性肥胖发生具有特定遗传背景，也有神经精神的因素。此外，内分泌失调因素亦可引起肥胖。
排查儿童肥胖症要先排除继发性肥胖，而继发性肥胖主要是下丘脑肿瘤导致，还有皮脂腺增多症、甲状腺功能减退症等原因，主要有以下几种：
第一，神经内分泌源性肥胖。神经内分泌系统的疾病导致的，继发性肥胖因下丘脑和下丘脑长瘤会导致激素分泌过多，从而引起肥胖。
第二，遗传综合征。一些症状可能病因不明，如色素视网膜炎、性功能减退、小胖威利综合征、多指畸形综合征，都要到医院排查。
第三，医源性肥胖。服用某些药物，如糖皮质激素、三环类抗抑郁药等，长期服用可能导致医源性肥胖。还有颅脑手术影响下丘脑也会导致医源性肥胖。儿童肥胖症要进行排查，排除继发性肥胖，再根据原发性肥胖治疗。
