囊肿虽然有可能并没有本身太大的伤害，但是要注意一点，就是因为发生在脑垂体部分比较重要，那么第一个有可能，会产生局部的压迫作用，囊肿本身有可能会压迫导致局部组织出现破坏，另外有可能影响内分泌。如果激素比较异常，必须口服药物来治疗，如果严重可以做手术。
脑垂体囊肿长到一定程度时，会压迫邻近的脑神经、垂体、视神经引起一种或多种症状，头痛、内分泌紊乱、导致小儿发育迟缓、女性还可能出现月经不调，甚至是闭经，不孕。面容及肢体上的改变。视力障碍。
垂体囊肿可以通过手术去除，可以开颅手术采用额下外侧入路，另外一个是经鼻蝶手术，也就是通过鼻内镜手术。前者的手术创伤大，后者的创伤小一些。当然，囊肿是良性的病变，如果现在囊肿很小，没有影响垂体功能，是没有必要做手术的，这不会有什么特别的影响。只有囊肿非常巨大，对于垂体和视神经造成压迫出现明显症状的，才有必要做手术处理。
不会导致死亡。如果没有特殊的临床症状，不需要任何特殊治疗来回顾最近大小和体积的变化以产生症状。可以考虑其他方法来处理它。脑肿瘤是颅内占位性病变。稍大一点的体积会立即导致颅内压升高，这是非常危险的。如果情况允许可以早期手术切除。
垂体肿瘤会引起闭经。在产后出现大出血，导致垂体的坏死功能减退造成，不能分泌促性腺激素。卵巢功能由于得不到垂体促性腺激素的分泌的刺激，不会有排卵，子宫内膜由于没有卵泡也，没有雌激素的影响，不会出现子宫内膜增厚或脱落出血，而不会来月经。也不能怀孕，所以出现垂体性闭经，可以使用激素替代治疗，能改善女性更年期的症状。
