进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
男科的检查项目包括外生殖器、直肠指检以及其他检查。
体格检查患者在男科还可进行阴囊触诊以及前列腺触诊，前列腺触诊主要是医生通过食指塞入患者肛门，通过与直肠接触，触摸前列腺，判断前列腺的大小以及质地，表面有无结节和占位性病变。具体检查项目可前往医院男科进行全面了解和检查。
其中泌尿系统需要检查阴茎、尿道、前列腺、睾丸、精索。看是否存在有影响生育的生殖系统疾病，如是否存在有隐睾、睾丸炎、是否患有梅毒、艾滋病等影响生育的一系列疾病。按照医生的要求检查。
大概包括精液常规，精液分析，前列腺液常规，前列腺彩超，睾丸附睾彩超，阴囊彩超，双肾彩超，膀胱输尿管彩超，尿常规，分泌物检查，分泌物培养等。如果男性查出精液有异常，需要检查染色体方面的原因。
男科检查都检查生殖功能和有没有性病。具体分析如下：
生殖方面，主要是看生殖器有没有异常，有没有其他的病变。首先要做的就是检查精子的精液，查看质量、活性、颜色以及液化的时间。同时还要做一些关于阴囊、阴茎、睾丸是否存在畸形以及精索静脉曲张等方面的检查。一般都是通过触诊和彩超来进行，通过血液检测可以防止这种疾病传播到女性，从而影响到生育。
