脑磁共振可检查血管疾病，如脑缺血，脑梗塞，脑出血，血管畸形等；可检查肿瘤病变，如良性囊肿，垂体瘤，脑膜瘤；恶性，胶质瘤，脑转移瘤等；可检查头外伤，如脑挫裂伤等；可检查鼻窦占位，鼻窦炎症。
脑磁共振可检查脑缺血、脑梗死、脑出血、占位性病变等。导致头痛的原因很多。常见原因，如休息不良或紧张性头痛，也可由高血压、脑血栓形成、脑供血不足、脑血管畸形、急性感染引起的发热性疾病如感冒、肺炎等引起。此外，颈椎病也会导致头颈部疼痛。服用特殊药物和遭受创伤也可能引起头痛。
做核磁共振是可以查出来是否有垂体瘤的，脑磁共振对于诊断脑垂体瘤具有非常重要的作用，而且磁共振检查是垂体瘤影像学检查首选的方法。通常通过磁共振检查可以了解肿瘤与海绵窦、脑池、颈内动脉、第三脑室的关系。但是，脑垂体瘤如果合并库欣综合征，有25%-45%的肿瘤在磁共振上不能显示，此刻需要依据症状及相关激素检查予以辅助诊断。
只有黄疸入脑引起脑损伤才需要做核磁，黄疸入脑原因很多，婴儿出现黄疸多数都是属于生理性黄疸，一个星期后会自动退黄。对于黄疸数值比较高的超过十七，也可以通过蓝光治疗帮助退黄，如果不是很高，可以晒几天太阳就能好。
仅仅根据这个磁共振报告，是无法判断具体病情的，需要结合孩子的症状及出生情况等来判断，现在除了打营养针，可以根据情况进行康复治疗。引起新的脑损伤比较常见的原因就是出生的时候缺氧或者是脑发育不良。根据化验结果来看是不能确定具体哪一种脑损伤的类型。关键还要看孩子的临床症状。
给新生儿做核磁共振，可判断新生儿的大脑发育情况，因为核磁共振不具有辐射性，所以优点非常突出，脑部CT对新生儿的辐射比较大，而核磁共振不是辐射成像，对新生儿没有辐射，核磁共振对新生儿脑部软组织结构显影非常清晰，可清晰地观察新生儿的脑部发育情况，其次是判断新生儿有没有核黄疸，如果新生儿有病理性黄疸，会出现胆红素水平明显增高，给新生儿做核磁共振时，如果新生儿脑部没有异常，基本可排除新生儿核黄疸。
