如果结石较大，可以通过，体外碎石或是手术治疗肾囊肿。平时多喝水，多运动，不要暴饮暴食，饮食以清淡为主，少吃高脂肪的食物，忌食油炸食物，动物脂肪及内脏，慎食蛋黄。手术后要多注意休息。
肾囊肿和肾结石两个疾病的治疗方式有一定的差别。肾结石可以吃一些药物来治疗，药物治疗效果不好的时候，也可以通过手术的方式来碎石，肾囊肿必须要通过手术的方式来治疗。
我认为主要取决于肾功能是否有所改变。如果囊肿的肾功能也发生了变化，要在彩色多普勒超声的定位下穿刺取囊肿。对于肾结石问题，它主要取决于结石的大小。如果小于电6公分，仍有可能将其排出。相反，我认为体外碎石术是普遍需要的。
针对肾结石，肾囊肿的病人，具体怎么办还是要根据具体结石的病情以及囊肿的病情来决定具体的治疗方法。
要给患者做彩超，CT及其他检查以明确肾结石具体情况和肾囊肿大小及其他病情。在这些方面都要根据患者实际的病情进行具体的分析，这样才能够制定出相应的方案。通常情况下，肾结石如体积较小，梗阻轻者可采用某些药物处理，许多患者都能以保守方式排出结石。如结石的体积较大，也许有必要用手术方法清除肾结石。在临床中通常会选择肾穿刺取石和经皮肾镜取石术这两种方式。肾囊肿通常都属于良性疾病，如体积小患者无症状，然后就能定期观察了，若囊肿超过四厘米，或认为囊肿可能恶变，则应积极手术。
通常，肾结石、肾囊肿，不会对怀孕造成影响，但怀孕后，如肾结石或囊肿伴感染或疼痛等，也许会影响妊娠。因此，若患者孕前检查查出肾结石或囊肿，仍建议患者做细致检查，若结石能够在孕前得到治疗则为最佳。
孕期如有肾结石落入输尿管内，导致肾绞痛或频繁重复的泌尿道感染，对于怀孕有一定的影响，有些人甚至可引起流产，连死胎也会发生。肾囊肿通常对于怀孕会有较低的影响，但亦有部分可并发感染，会导致发热，这类患者孕前还需有所防范，减少疾病对身体的危害。
肾结石与肾囊肿的B超检查截然不同，具体区别如下：
肾脏囊肿与肾结石是两种截然不同的病症，其病因及发展与此种预后疗法截然不同。这两种病都有自己的特征，常规的尿路检测，一般都会进行b超的无创性和最简便的筛查。b超是一个非常有规律的囊肿，里面充满了液体，有一个很大的囊。超声波是指利用超声波的反射，来研究其内部的结构。肾结石大小不一，在超声波中，是一个很大的亮点，在后部，会出现一些强烈的回音。常规的B超是最常见的。有一项叫做KUB的腹部平片，结石位于肾部位，会呈现高密度影的不规则图像，正常的时候是看不到的，但是ct检查会更加清晰，特征也更加突出，这是一个高密度的肾盂肾盏。结石的形状和部位都是非常清晰的，囊肿是一种密度很高的液体，很容易分辨。