磁共振检查是利用氢质子成像，氢质子带正电荷并作自旋运动，产生磁场，并具有极性。人体含有丰富的氢质子，其极性排列自由无序。CT增强扫描是通过静脉高压注射造影剂，在CT机的扫描下，观察动脉期、门脉期、平衡期及延时期病灶的强化特点来鉴别病灶的性质。
腰疼拍CT还是核磁共振，需要根据具体情况来定：
第一种是腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰椎压缩性骨折等疾病，可以采用CT扫描来明确诊断。第二，腰椎核磁检查的主要适用于高位腰椎间盘突出，以及多节段的腰椎间盘突出，一般CT不能完全反映腰椎的突出情况。所以当腰椎突出范围很大的时候，最好做核磁共振检查。另外，腰椎血管瘤、原发性腰椎、继发恶性等疾病，需要进行MRI检查，以明确病变存在部位、骨质破坏的情况。
腹部核磁检查的内容主要为上腹部脏器，如肝脏、胆道、胆囊、胰腺、胃肠道以及双肾等。对于上腹部核磁检查，可分为平扫+增强，可以进一步明确病变的性质，比如有助于鉴别肝脏肿瘤的良恶性，并且可以发展肝脏内微小病变，同时可以行MRCP检查，胆道成像，了解胆管有无狭窄，有无结石等。
头疼拍ct比较好。头痛是日常生活中的常见症状，CT检查较实惠，较低费用即可解决部分较大的问题，如是否存在肿瘤或出血等，且大部分引起头痛的原因通过CT检查即可解决；若出现神经痛或颅脑神经压迫病变，MR检查效果更好，但MR收费相应较高。若患者出现头痛现象，医生将根据头痛不同的性质、部位、症状安排不同检查。若患者为持续、反复跳痛，且疼痛迁延不愈，则应进行磁共振检查观察神经的情况。引起头疼的原因是比较多的，建议根据头疼的原因进行选择，可以在医生指导下进行相关检查，确诊后治疗。
磁共振没有去做全身检查的，做检查收费都是按照部位来收取，人体上下有10多个部位，还有不同的扫描序列，只要有侧重点选择性的做必要的检查就行了。关于收费价格，全国各地都是不一样的，跟医院的等级，磁共振的机型都有一定关系，一般500-800元每个部位平扫，强化扫描每个部位要在千元以上，脑血管成像也在千元以上。
核磁共振和ct，ct辐射大。磁共振是人体细胞内的氢原子核在强大的磁场空间内，产生共振运动，经过一系列重建技术转换成磁共振图像用于临床诊断，所以磁共振是没有电离辐射的。而CT却是利用X线成像原理形成图像的，所以CT是有X线电离辐射的。
