临床上主要用于治疗急慢性荨麻疹、过敏性鼻炎、皮肤瘙痒症等过敏性疾病。因受体选择性差，可通过血脑屏障，引起中枢镇静作用，可引起嗜睡、头晕、恶心等反应，个别人可以有失眠、烦躁等兴奋症状，所以癫痫患者禁用。
服用后可能会出现一些少量的胃肠道不良反应，如便秘，腹泻，肠鸣，口中麻木的症状，偶见肝功能中谷丙转氨酶和谷草转氨酶升。会出现心悸，心慌，胸闷，头痛，眩晕，困倦，嗜睡等不良反应，在停药后这些症状就会消失。
马来酸曲美布汀片的适应症为胃肠道运动功能紊乱引起的食欲不振、恶心、呕吐、嗳气、腹胀、腹鸣、腹痛、腹泻、便秘等。马来酸曲美布汀片是临床上常用的治疗肠易激惹综合征的药物，该药可以调节胃肠的蠕动，可诱发成人消化系统生理性消化道推进运动，可使胃排空功能的减弱得到改善，同时，还可使胃排空功能亢进得到抑制。
本药没有明确规定饭前还是饭后服用，因为马来酸曲美布汀片具有调节胃肠道运动及镇吐的作用，用于治疗胃肠功能紊乱所导致的恶心呕吐、食欲不振、便秘等症状，也可以用于肠易激综合征等，所以饭前服用效果较好。
这种药物用于由胃排空延缓、胃食管反流、食道炎引起的消化不良症状，上腹胀闷感、腹胀、上腹疼痛；嗳气、胃肠胀气，恶心、呕吐；由于反流引起的口腔和胃烧灼感。各种原因引起的恶心、呕吐，如功能性、器质性、感染性、饮食性、放射性治疗或化疗。
所有患者如果病情需要都可以终生服药，定期监测心电图、肝肾功能等就可以。马来酸氟伏沙明是选择性5-羟色胺再摄取抑制剂之一，在临床上，用于抑郁症及相关症状的治疗和强迫症症状的治疗。
