甲亢吃赛治的副作用通常有皮疹或皮肤瘙痒及白细胞减少；较少见严重的粒细胞缺乏症；还可能致味觉减退、恶心、呕吐、上腹部不适、关节痛、头晕头痛、脉管炎、红斑狼疮样综合征。可能罕致肝炎、间质性肺炎、肾炎和累及肾脏的血管炎。定期监测血常规、肝肾功能和甲状腺功能等。
一般来说，对于甲状腺功能亢进的药物，其不良反应主要有三种：
第一种情况，就是服用了药后会有皮疹，这属于一种过敏性的症状，一般会在全身和身体的不同地方都会有皮疹。
第二种是肝功异常，转氨酶增高是甲亢病人的主要症状，肝功异常、转氨酶增高等都很常见。
第三是由于服用了甲亢药物，导致白细胞减少，白细胞的总量减少后，嗜酸性粒细胞的绝对数值也会减少。
甲亢指的是甲状腺功能亢进症。通常情况下，甲状腺功能亢进症患者吃甲巯咪唑有腹部不适、恶心、呕吐等副作用，如果甲状腺功能亢进症患者吃甲巯咪唑出现了以上的症状，应及时停药，以免身体出现不适。
甲状腺功能亢进症患者配合治疗的同时，还应注意休养，避免劳累，注意保暖，多喝热水，多食用清淡的高蛋白食物，比如鸡蛋、牛奶、鸡肉等，还可以适当的进行运动，比如做操、散步、打太极等，促进身体恢复的同时，还能提高免疫力。
近期内可以出现一过性甲减、一过性甲亢或者甲亢复发、放射性甲状腺炎、疼痛等症状，通常都能自行缓解和恢复。远期除永久性甲减外，还有可能对比邻组织如甲状旁腺等造成影响，但较为少见。
甲亢同位素治疗最常见副作用为甲状腺功能减退。放射性碘直接杀死体内的甲状腺组织，可导致病人出现甲减，而一旦出现甲减，就需要终身服药。另外，放射碘治疗后，短期向体内释放大量甲状腺激素，可导致短期内甲亢症状加重。而重度甲亢病人在放射碘治疗后可能出现甲亢危象。合并甲亢突眼的病人，在放射碘治疗后突眼可加重。由于碘具有放射性，在同位素治疗后可能出现放射性甲状腺炎，甲状腺肿，甲状腺萎缩等。
服用抗甲状腺药物所导致的副作用，像白细胞减少、药物性皮疹、关节疼痛、胃肠道疾病、血清谷丙转氨酶增高，以及药物性肝脏损害等。全身抵抗力显著下降。甲亢时甲状腺激素分泌过多，促进精、脂肪、蛋白质三大营养物质代谢，加速氧化。