鱼腥草带有很浓烈的鱼腥味。服用鱼腥草泡水后，口气会变臭，短时间内也很难消掉。喝鱼腥草泡水可能会出现过敏反应，主要的表现身体出现药物性皮炎、末梢神经炎、过敏性紫癜等症状。鱼腥草含有马兜铃内酰胺。马兜铃内酰胺诱发肾脏损伤与马兜铃酸类似，过量食用鱼腥草可能引发马兜铃肾病。由于鱼腥草性寒，所以比较适合肺热体质的人服用。服用过多的鱼腥草泡水很有可能导致体寒，从而引起腹泻等症状。
怀孕可以喝鱼腥草水。
鱼腥草水具有清热解毒、抗菌的作用，孕妇饮用后可以缓解部分病症，还可以提高孕妇的抵抗力。注意鱼腥草水偏凉，不可频繁饮用，避免对身体以及胎儿造成影响。建议孕妇在怀孕期间注意饮食均衡，不要食用辛辣、刺激的食物，可以多吃一些新鲜的蔬菜和水果，及时补充怀孕时所缺的维生素，孕妇还需要保持良好的生活习惯，不要熬夜。
鱼腥草具有清热解毒消炎的作用，是可以用鱼腥草煮水清洗外阴的。因为阴道炎是属于阴道内的炎症，如果阴道分泌物较多，只是清洗外阴起不到很好治疗作用的，根据阴道炎的类型，配合阴道内上药治疗，治疗期间不要吃油腻辛辣刺激性食物，注意局部卫生干净。
复方鱼腥草合剂是一种具有清热解毒功效的中成药。用于咽喉肿痛疾病的治疗，风热感冒导致的咽喉肿痛，急性咽炎、扁桃体炎导致的咽喉肿痛。在保护人体健康和提高人体的免疫力显著的作用。
慢性细菌性前列腺炎不宜多吃鱼腥草，鱼腥草具有一些消炎的作用的，慢性细菌性前列腺炎是可以进行食用的，但是要适量的进行食用，慢性细菌性前列腺炎平时是不能吃煎炸油腻、辛辣刺激、含糖量高的食物，每天要吃些肉蛋奶以及豆制品以便能适当提高些免疫力促进病情尽快恢复。
都具有清热解毒的功效，前者具有疏散风热作用，后者有消痈排脓、利尿通淋作用，饮用要适量，脾胃虚弱者不要饮用，用适合夏秋两季，记住不要用开水，因为开水会使功效流失。
