如果是单一囊肿，没有影响到肾脏功能，可以考虑暂时不进行外科手术治疗的，平时注意休息，其次就是定期复查看看囊肿是否有进行性长大的情况存在，如果继续长大，及早手术还是比较好的。对于囊肿目前还没有药物进行治疗，主要是外科手术或者是观察。
肾囊肿可以分为单纯性肾囊肿和多囊肾。单纯性肾囊肿大多没有症状，一般在健康查体时偶然发现，单纯肾囊肿一般不需要特殊处理。除非是体积比较大，超过四公分，出现了压迫症状，或者是出血感染。但也没有口服药物治疗，一般要超声引导下注入硬化剂或者是腹腔镜微创手术去顶治疗或者是开放手术切除。
不管中药还是西药肾囊肿靠药物是无法治疗的，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。
肾囊肿的形成因素是多方面的，对于单纯性肾囊肿主要是由于肾脏的集合管堵塞，造成尿液分泌受阻，从而逐渐的形成囊性的扩张，引起肾脏囊肿。多囊肾于先天性遗传因素有关，属于常染色体遗传病。
目前还没有治疗肾囊肿的药物。对于肾囊肿的处理，主要是根据囊肿大小、部位以及是否合并感染或者破裂等情况做出决断。囊肿＜五厘米，而且没有不适临床症状，可以定期观察，不用处理。
