引起胎停育的原因有很多，主要是胎儿的染色体异常为主要原因。环境的因素，空气污染等这些都可能会引发胎停育。另外如果子宫环境不利于胚胎着床，比如子宫壁太薄或者是太厚，子宫出现肌瘤、还有异位症也会导致胎停育。最后就是妈妈自身的原因，如果孕妇出现雌激素、孕激素太低，也会导致胚胎无法正常的发育。
子宫异常，子宫里的内环境和子宫整体的环境都有可能对胚胎有影响。内环境就是子宫内膜，如果太薄、太厚都会影响着床。由于子宫缺陷引起的流产约占10%~15%，常见的有(1)先天性苗勒氏管的异常包括单角子宫、双子宫、中隔子宫及双角子宫致宫腔狭小，血供受到限制。
胚胎停止发育可能跟男性精子质量差有关系，常见原因有染色体异常、免疫功能不全、内分泌功能紊乱、子宫内环境异常、遗传性血栓形成倾向、全身感染性疾病等女性危险因素、精子成熟障碍等男性危险因素、环境不良等因素。
胚胎停育的原因非常多，大部分都是因为胚胎本身染色体发育有问题，以数目异常比较常见。遗传性因素、生殖器感染、感染性因素、内分泌性因素、解剖因素等都会导致出现胎停育。
怀孕胎停育可能是以下原因引起的：
如果孕妇进行的B超检查结果发现胚胎停育，那么就可能是受精卵形成时当中所存在的精子或卵子携带的染色体出现了异常，就使得形成的受精卵质量异常所导致的胚胎停育，也可能是怀孕期间患有感冒等疾病后，孕妇自己随意的使用药物对胎儿产生影响所引起的。还可能是患有的黏膜下子宫肌瘤等生殖系统疾病造成的胚胎停育。
孕妈妈自身的因素；黄体功能不全；外界因素：工作环境的影响，有的孕妈妈工作环境不适合胎儿发育，放射线，有毒化学物质等，都会影响到胎儿的发育；社会环境影响、社会环境、噪声污染、环境污染等也可能造成胎儿停育。