自然流产第三天了腰疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
如果女性在自然流产后三天会感到腰痛，可能是由于受了某种寒气的刺激，也可能是由于没有休息好，也可能是由于工作过度导致的。在流产后要多休息，不要过度劳累，不要做太多的体力活，要让自己的情绪得到充分的释放。同时要注意保持外阴的卫生，经常更换卫生巾，在一个月之内不能同房。需要到医院做个全面的检查，确定是什么导致了自然流产，然后才能对症治疗。
怀孕以后出现的自然流产一般属于胚胎发育不好的情况，是人类进化自然过程适者生存的表现。自然流产后，阴道出血的时间一般不会超过10天，但是流血量会比正常来一次月经量要多。如果B超检查宫内干净，可不必处理。等下一次来月经之后，可以选择同房。但是同房期间需要采取避孕措施。自然流产以后，不要在第二个月就怀孕，最好是自然流产半年以后才准备怀疑，对女性身体都比较好。
通常情况下，自然流产的女性建议在三个月后要宝宝。具体情况分析如下：
自然流产是指胚胎不经过任何医疗干预，而发育停止，最终经阴道完全流出体内。临床上定义自然流产是在女性妊娠期小于28周，胎儿体重不足1千克的情况下，终止妊娠虽然自然流产对子宫内膜的损伤比较轻，但也需要休养一段时间再要宝宝。如果自然流产不干净，一般要到医院做清宫，这样的话，一般要休息半年左右，然后再做准备。
自然流产清宫后建议半年左右再次怀孕。
孕囊或胎儿自发性排出宫腔即自然流产，没有人工干预，自然流产后复查B超，若宫腔内有残留则需要进行清宫。建议半年后再怀孕。主要原因是：
1、恢复半年左右的子宫内膜功能得到较大的缓解，子宫内膜经过多次的增生、分泌、脱落，子宫内膜功能得到修复。
2、恢复半年左右，女性平复心理，能较好地为再次怀孕做准备。
自然流产是否有清宫主要取决于胚胎组织的排出情况。具体情况分析如下：
正常情况下，自然人流后要到妇科B超看一下宫腔中的胎儿，如果宫腔中的胎儿组织全部流光了，不需要进行清宫，多休息，让子宫和人体慢慢的康复。B超提示胎儿体内有残余的胎儿，用药都不能排除，需要做的就是做清宫，防止胎儿在宫腔里滞留，造成大出血。
自然流产半年后可以再次备孕要孩子，再次备孕前一定要检查一下导致自然流产发生的原因，如内分泌紊乱，或者有免疫方面的问题，再有溶血方面的问题，也有染色体方面的问题，或者宫腔有问题都会导致自然流产的发生。
