肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
肛瘘的临床表现是外口反复流出少量的脓性分泌物或者粪水，分泌物时多时少，由于分泌的刺激可引起肛周皮肤瘙痒，有时还有气体从外口溢出。如果外口关闭，由于引流不畅可再次出现肛周脓肿的表现，如局部的红肿热痛，严重者可出现发热，乏力等全身中毒症状。
肛瘘多久能痊愈；手术后按时换药，平时注意卫生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。避免一直保持同样姿势，坐着工作的人每隔一小时要能走动三、四分钟。
肛瘘挂线手术是目前治疗肛瘘最有效最常用的方法，手术腰麻下进行，手术过程中是感觉不到疼的，手术操作首先将窦道探明，就是将皮筋从窦道外口穿入，内口穿出，然后经肛门打结，勒紧，术后通过皮筋持续性收缩，逐渐将窦道勒豁，然后窦道从里向外愈合。
做肛瘘手术需要住院的时间，因人而异，大部分情况下都是在一周左右，出院后还需要在家休养一两周才可以，自己注意饮食结构，需尽量保持营养丰富清淡的，预防便秘，大便之后还需要注意对伤口处进行清创消毒，避免大便刺激伤口。
