进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
肛肠科检查方式有很多种，可有肛门视诊，即用拇指轻轻分开病人的臀部，观察肛门及肛周有没有脱出物、外痔、外口、脓肿，也可以看到肛门周围有没有色素沉着，有没有裂口，如果有裂口，应该观察一下裂口的位置、裂口的种类及个数。
可以做彩超检查，配合做尿常规检查，如果出现了急性膀胱炎，可能会出现尿急尿频。并且需要防止膀胱炎，导致出现上行性感染，反复发热比较容易出现肾炎的情况。平时多注意休息。
如果同房导致妊娠，可以在7-10天后用早孕试纸进行检测，也可以到医院采血检测HCG和孕酮，可以初步诊断妊娠。现在怀疑自己怀孕了，可以去药店买一个怀孕测试棒或早孕试纸来测试，以确定怀孕，月经推迟约10天前去医院做B超检查，以确定是否怀孕。
肛肠科疾病最常见的是痔、肛瘘或肛周的疾病，其临床表现为动态变化，以及症状与体征不平行两大特点，肛肠科疾病的检查都会做一些常规的检查，包括肛门周围的视诊和触诊，然后是肛门镜检查，包括内镜、超声、CT以及化验等。
