进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
贫血检查主要是依靠血常规还有血涂片，看一下红细胞还有血红蛋白的明显降低。具体原因，要看一下它的造血原料，首先查一下贫血三项，看有没有铁蛋白的降低，还是叶酸、维生素B12的降低，这种属于营养不良性贫血。对于一些恶性病引起的贫血，要进行骨髓穿刺、细胞血检查，通过观察红细胞的形态以及性质，确定贫血的原因，要去医院进行就诊。
胃镜检查时，医生右手持镜前段将胃镜放入舌根部，此时病人进行吞咽动作，将胃镜送入食道，而后继续向下送镜子观察胃及十二指肠情况。肠镜是利用一条装有微型摄影机的纤维软管进行检查，其由肛门进入肠道，顺势观察肠腔情况。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
ERCP是内镜逆行性胰胆管造影的英文缩写，手术是在纤维十二指肠镜直视下，通过十二指肠乳头，将导管插入胆管和胰管内进行造影，可直接观察十二指肠及乳头部的情况，病变取材活检。
