小孩子咳嗽和扁桃体肿大是两个疾病，如果咳嗽久治好不了，需要排除鼻窦炎引起的鼻涕倒流到咽喉部，引起的反射性咳嗽可能。而扁桃体单纯性的肥大，是没有关系的。小孩子的咳嗽如果已经排除了下呼吸道的感染，可以到耳鼻咽喉科，遵医嘱进行治疗。
儿童的扁桃体肿大，主要看临床表现以及症状。如果症状很明显，需要进行手术治疗，症状包括反复发炎、呼吸困难、睡眠打鼾或者吞咽困难、言语不清。如果反复发现或者进行性加重，只有一个办法是行扁桃体切除术。
扁导体肿大是否手术需视病情而定。针对没有出现打鼾症状、呼吸困难、扁桃体化脓的扁桃体肿大，这种是不需要特别处理，如果出现以上症状，就需要考虑年龄后再做手术的切除。
一般情况下，小孩扁桃体肿大，可以通过药物治疗、手术治疗等方法进行治疗。具体分析如下：
1.药物治疗：小孩扁桃体肿大，多见于急性扁桃体炎，伴有发热、轻咳、咽痛等症状，家长可以在医生的指导下使用复方金银花颗粒、阿莫西林胶囊、罗红霉素片等药物给宝宝治疗。
2.手术治疗：小孩扁桃体持续性肿大，即使予以抗感染等对症治疗，依然无效，可以考虑手术切除扁桃体。
家长要让小孩多休息，注意保暖，空气注意流通；平时要让宝宝多喝水，预防脱水，同时加强营养摄入。
儿童的扁桃体肿大常常会引起睡眠时打鼾，也就是打呼噜，导致晨起乏氧、犯困、注意力不集中、没有精神头。如果扁桃体反复发炎，还容易引起其他的相关疾病，比如心肌炎、肾炎、关节炎等。
小孩因扁桃体肿大晚上睡觉打鼾如果不是很严重，平时可以多喝点水，可以吃水果青菜，另外可以应用一些清热去火的药物，如果是症状严重，睡眠过程中出现睡眠呼吸暂停，引起睡眠缺氧明显，那是需要进行手术处理的，可以手术切除扁桃体，这样能够呼吸通畅，避免夜间缺氧。