甲状腺囊肿通常不会自行消失。
甲状腺结节或甲状腺病变，可能与机体碘缺乏病等有关。一般情况下，如果身体无其余不适症状，应定期复查工作，定期随访，囊肿大，影响身体功能，出现呼吸窘迫，应及时进行治疗处理。创造良好的生活习惯休息时间，避免长期疲劳、熬夜等，适当休息。如出现身体异常，及时到医院检查，明确具体情况，避免拖延时间。
甲状腺囊肿最有效的治疗方法是手术切除。如果选用穿刺可以将囊肿中的液体抽出，短期效果很明显，病人也没有什么痛苦，但是囊壁仍然保留，之后还有形成囊肿的可能，所以手术切除是目前对于治疗甲状腺囊肿最可靠有效的方法。
一般来说，甲状腺囊肿能治好。
甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物。一般情况下，甲状腺囊肿属于良性病变，通常能治好。如果囊肿肿大不影响到颈部外观，或者压迫其他的器官和喉返神经，观察即可；如果特别大，影响美观，或造成身体不适，可以进行囊肿摘除术。
患者在日常生活中应当加强身体锻炼，注意保暖，饮食清淡，不吃刺激性食物多，吃富含钙质的食物，不要吃刺激和油腻的食物。
甲状腺囊肿的危害主要与囊肿的大小有关，小的囊肿并不会造成危害，但是囊肿比较大的时候可能会引起颈部不适，甚至压迫气管和食道，出现吞咽困难、呼吸困难等症状，所以甲状腺囊肿的主要危害在于压迫症状，同时也有可能继发感染破裂或癌变。所以甲状腺囊肿的危害比较大，小囊肿定期检查不会有太大的问题，如果囊肿比较大，可以做甲状腺手术、硬化或者射频消融等治疗。
甲状腺囊肿属于良性疾病，当囊肿较小时，对人体的身体健康没有影响，一般不需要特殊治疗，定期进行甲状腺彩超，甲状腺功能检查等随访。如果囊肿持续增大，出现压迫症状，或者疑有癌变，应择期慎重考虑手术治疗，术后长期以甲状腺激素替代。
随着囊肿的逐渐增大，给甲状腺周边组织带来一定的压迫等一系列危害，可归纳为以下3种危害：
1、颈粗囊肿所致，质地一般较软，肿大明显时，颈前肿块可向前突出落下或向后压迫，导致咽不畅，咽困难，引起吞咽阻力感。
2、不同程度肿大可出现颈部淋巴结转移；此外，表现为咽不畅、吞咽时呛咳、声音嘶哑、Horne症状(病侧瞳孔缩小、上睑下垂、眼球内陷、同颞无汗等压迫症状)。
3、组织发生缺血性坏死，即形成坏死性囊肿。周围组织坏死，血管失去组织支持破裂，就会形成出血性囊肿。出现浆液性、出血性、坏死性囊肿时，囊壁多为纤维结缔组织，上皮细胞较少。
