肝内胆管结石不会自愈。如果患者有手术指征及早进行手术治疗。采取的手术方式是高位胆管切开取石术。如果患者肝内胆管结石造成某一叶的肝脏萎缩，可以行肝部分切除或者肝段切除。
通常情况下，引起肝内胆管结石的常见原因有胆汁的排泌障碍、细菌感染、寄生虫感染、先天的胆管扩张症等。
胆管结石是临床胆石症的一种，临床上最常见的症状是上腹部疼痛，可呈胀痛或是绞痛，部分患者伴有发热。肝管梗阻时，可出的黄疸，通常来说，引起肝内胆管结石的常见原因有胆汁的排泌障碍、细菌感染、寄生虫感染、先天的胆管扩张症等。
胆囊结石且胆囊萎缩应该手术治疗，因为胆囊结石的癌变率大概10%，当胆囊出现萎缩的时候，说明胆囊的功能就不健全了。这时候胆囊既然没有功能，里面又有大量的结石，这样引起癌变几率比较大。
胆囊结石可能是以下原因引起的。
胆囊结石是由多种原因造成的，不管是什么原因造成的，都会导致胆汁的酸性、胆固醇的代谢紊乱，从而导致胆汁在胆囊内沉积，从而导致胆囊内的结石。肥胖、长期暴饮暴食、高脂肪、高蛋白饮食、高脂血症、糖尿病、胃肠道手术、肝硬化等都属于高风险的危险因子。另外，一些年轻人因为不喜欢吃早饭，导致胆囊中的胆汁滞留太久，导致了胆囊结石的发生。
肝内胆管结石能活20年-30年。肝内胆管结石不影响寿命，它是一种良性的病变，并不是癌症，也不是恶性的肿瘤。要保持良好的心态，生活要有规律，作息的规律，避免劳累以及精神的高度紧张。可以采用积极的治疗来去除肝内胆管的结石。
肝内胆管结石和肾结石都是临床上比较常见的疾病，这些都是良性病变，导致这种疾病的原因与个人的体质有关系。严重者也可以通过外科手术来治疗。日常生活中避免吃太油腻的食物，多饮水，勤排尿。肾结石病因：肾结石的原因包括由于细菌的感染，可使结石胆红素水解为游离胆红素，游离胆红素颗粒，以脱落细胞，寄生虫卵等为核心，在胆汁中粘蛋白的帮助下，不断沉积，形成结石。
