通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
可以口服些药物进行身体代谢调理，保证身体代谢的正常运行，日常生活中辛辣油腻的食物尽量少吃或者干脆不吃。少用化妆品，即使要使用，也要保证化妆品的安全来源。
如果囊肿持续存在，那就属于病理性的，这个大小的囊肿，没有别的什么办法，只能选择手术的方式治疗。如果没有不舒服的情况，可以暂时不用治疗的，有时候可以自己消失的，在平常的时候饮食需清淡，忌食辣椒、生葱、大蒜、白酒等刺激性食物及饮料，禁食红枣。
头皮囊肿可以通过手术的方式来进行切除治疗，但是相对来说这种使用药物治疗的话，作用并不是有太大，所以需要当地的正规医院，检查完以后看囊肿是有多少，包括面积有多大来进行治疗。
肛周脓肿的检查方法，首先是视诊，视诊是用肉眼看，可以明显的看到肛旁有肿块，用手指摸可以摸到有硬结或者波动感，触痛也比较明显。可以用肛门镜检查，看到感染的肛窦，肛隐窝做指检，可以摸到感染源，肛周脓肿的脓液和脓包位置高和低，这是最常见的诊断方法。其次还有腔里的B超检查，可以明确诊断肛瘘的肛周脓肿范围，还有感染最原始的地方在哪里，这是肛周脓肿最基本的、最常见的检查方法。
颅内囊肿如果是继发性的，脑囊肿一般指蛛网膜囊肿、皮样囊肿和上皮样囊肿。均属良性病变，也可有头疼等症状。一般药物只能对症治疗，不能消除囊肿。可定期复查对比。囊肿较大或症状较重时可手术切除。要看如果比较小，可以观察，囊肿大有压迫症状所以经常有头痛，头晕，癫痫等，是会影响学习和生活的。如果不及时治疗，会严重影响生活。比如出现颅内压增高，头痛，恶心、呕吐，会引起癫痫等，或者可能出现脑积水等。如果有明显症状和占位较大的话，需要手术治疗。
