出现阴茎短小一般和个人体质、自身发育有关系另外注意身体是否肥胖，如果肥胖也可以影响，要注意饮食，避免肥胖，多活动。如果阴茎勃起功能正常，可以暂时观察，不必采取手术治疗。如果要想延长，可以采取阴茎延长术治疗，可以到正规医院外科就诊，根据病情采取手术治疗。
一般情况下，男性生殖器短小可以通过生活护理、手术治疗等方式改善，具体内容如下：
男性生殖器短，只要不影响性生活，不影响生殖功能，可以通过调理肾脏来调理，可以口服六味地黄丸、五子衍宗丸等中成药，多运动，强身健体。如果影响到正常的性生活，可以选择到正规的泌尿外科进行阴茎延长手术，这样可以使阴茎延长3-5cm。但这种手术对病人的精神压力很大。
男性的生殖器都是先天发育定型的，到18-20岁，就已经定型了，是没有好的办法改变的。
阴茎过小最常见的原因，与先天性的发育有关，发育与营养状况不良都会导致阴茎过小。男性的生殖器官在成年之后，就会定形，不再发育。其次内分泌紊乱、阴睾或阴囊肿胀产生的阴茎“回缩”等，都可能造成阴茎短小。想要阴茎变长，只能通过做阴茎延长手术。
出现先天性阴茎短小的情况，首先说这个年龄不可能再有阴茎二次发育，所以不要再寻求药物治疗来改善症状，如果是有明显的阴茎短小情况，建议可以在当地的公立医院就诊，阴茎延长术是实现成人阴茎延长的唯一方法.由于它是一个技术含量非常高的手术，建议选择正规专科医院。
小儿男性生殖器先天畸形主要是胚胎发育时一些原因导致睾丸分化不完全，出现萎缩变形，即无睾症。
部分可能有间质细胞，有男性外生殖器和男性外貌，单睾丸多数不用治疗，手术检查主要是找出腹腔可能存在的隐睾，防止癌变。还有多睾丸，有三个或更多睾丸，大小不一，睾丸发育不全，比正常的要小，非孤立性的症状或其他表现，睾丸因增生变大会有睾丸畸胎瘤，还有可能有先天萎缩，位置异常，如隐睾症、睾丸融合、异位睾丸。
