可以先用保守治疗一段时间，但是要及时观察，当肿瘤长大较快时最好的方法是手术治疗，但是切除以后还会有复发的几率，所以在手术以后要进行放化疗，然后配合药物提高身体免疫力防止复发。
如果是良性的，手术以后就能治愈，不会影响正常的寿命。如果是恶性的，大多都容易复发，不能切除者生存期大约在9~12个月左右，原发灶切除彻底无转移病灶者最长可存活5年左右。
不是癌症，属于恶性肿瘤。确诊为胃间质瘤，一定要到正规的医院去进行手术切除肿瘤，如果不及时进行手术治疗是很有癌变的可能。如果手术治疗的效果不是特别好，可以进行放疗治疗。
胃间质瘤首先应该考虑选择手术切除肿瘤这样的治疗方案，手术方式主要采用胃楔形切除术。该手术方式适用于肿瘤位于胃底、胃体部位，且肿瘤突出于浆膜，肿瘤直径在1.0cm～3.0cm。
胃底间质瘤与癌症是两个不同的概念。所谓间质瘤是原发于胃黏膜下的肌肉层交界性肿瘤，那么根据肿瘤大小以及其核分裂象通常分为良性间质瘤和恶性间质瘤。对于良性间质瘤通过手术切除就可以达到治愈。恶性间质瘤通过手术切除以后，并定期复诊。而胃癌通常需要手术根治切除，并术后配合化疗。
