如果是比较小的囊肿，直径在4cm以下的对肾脏实质并不造成压迫，平时也没有明显临床症状的可以动态观察，不用处理。如果囊肿的直径超过了5cm以上，伴随有腰部酸胀症状，需要通过穿刺或者手术治疗。如果囊肿直径在6cm以上，不论是否有症状都建议做手术治疗。
无自觉症状，也不需特殊治疗，况且药物保守治疗效果不明显。可以定期复查，如果囊肿增大较快或有性质改变，可以考虑手术治疗。囊肿不是实质性恶性肿瘤，也不是肾脏的器质性疾病，囊肿较小对肾功能及身体其他方面没有不良影响。
小的囊肿暂时不需要治疗的，随访观察就行了，超过5厘米大的囊肿可以手术治疗，一般选择微创手术封闭治疗，效果还是很好的，不过有复发的现象的。平时规律生活，少吃辛辣刺激的食物，适量运动，定期复查。
肾囊肿病人一定要做好日常生活的饮食工作，首先不能多吃高蛋白的食物，如鸡、鸭、鱼、肉、蛋、牛奶、大豆、豆腐以及其它的豆制品，但是只是说不能多吃，并不是说不能吃，避免体内一个蛋类的代谢物大量的合成，可以减轻肾脏的负担。再者腌制和发酵性的食品也不要吃或者少吃，如豆腐卤、不卫生的食物、腐烂变质的剩菜剩饭等。最后也应该注意禁忌酒类的食品，特别是白酒，酒类可以刺激多囊蛋白的活性，加速囊肿的生长。
肾襄肿需要到泌尿外科进行治疗，进行微创手术的方法治疗，或者是超声引导下穿刺抽液治疗。平时要注意生活规律，按时休息，不要熬夜，低盐低脂清淡饮食，避免剧烈运动，避免过度劳累。