如果不是很复杂的肛瘘，通过手术就可以恢复。另外外用消肿止痛的中草药进行日坐浴。局部涂抹抗生素软膏。如果急性期可以口服抗生素，对症处理，不要超过一个星期。如果比较复杂，内口不确切的肛瘘有可能会复发，要清淡饮食，不要过多食用辛辣油腻上火的食物，注意局部的卫生。
患有肛门脓肿的一般都可以用多普勒超声检查是否有肛瘘，它是可见的，到三级以上的正规医院做肛肠检查，可以做肛门指检查和肛门内窥镜检查，也可以进行局部彩色多普勒超声和CT检查，找出症状的原因治疗，必要时手术治疗。
平时将心情保持乐观平常心，不要焦虑上火，也不要压力太大，在饮食上，要规律的饮食，不要过度饮酒。当然治疗是关键。也要及时到医院就诊，及时涂抹专业有效的药物，或者其他专业治疗。
肛瘘不按期分。肛瘘分为低位肛瘘和高位肛瘘。瘘管管道位于肛门外括约肌深层以下的肛瘘就是属于低位肛瘘。瘘管管道位于肛门外括约肌深层以上的肛瘘就是高位肛瘘。
肛瘘的发病很复杂，现在机理不明确，临床上主要以肛腺的感染为主，肛腺长在肛门内，一般看不到，而且肛腺它的作用，跟腮腺的作用是一样，会分泌一些液体软化大便，肛腺口张开细菌进去以后就容易造成感染。这种感染首先表现的是肛周脓肿，就是肛门周围起疖子，但是大部分离肛门近的疖子，基本上都考虑是由肛周感染而来，必须要手术。
