通常手术治疗是有效果的，导致精子畸形的原因常见于药物作用和精索静脉曲张，可以到医院检查治疗，在医生的指导下正规用药。简单的说畸形精子症就是发育不好的精子，正常男性的精液分析出，精子密度在每毫升两千万以上，A级精子就是直线运动的精子大于或等于25%，但是，头部正常形态的精子小于30%，就可以诊断为畸形精子症。
男人精子少，可以吃人参，其中所富含的植物性荷尔蒙可提升固酮的含量，并增加精子的制造量和性活动频率。鸡蛋是一种常见的食物，其中含有多种维生素以及矿物质，可谓补精子的必备食物，果仁，是因为果仁能够促进男性性激素的分泌，肉。包括了鸡肉、猪肉在内的各种常见肉食，也包括了诸如羊肾、牛鞭等常见的补精食物。
在临床实践中，男士精液检查需进行以下几个项目：
一、精液定期检查。精液常规中包含了精液数量、精液的液化时间，精液的特征，有无凝集等、精子数量，精子活动度和精子密度，同时，还可采用染色方法检查精子有无畸形率升高。
二、精液质量检测。
三、精液分析及结果解释。包括精子穿透试验和精液中支原体，衣原体和链球菌及一般细菌检查。
取精的方法采用手淫取精的方法来进行。在密闭的空间内，通过手淫的方法诱发射精，从而来采取精液标本。在进行精液常规前最好禁欲2-7天，这样的精液标本比较可靠，对于检查结果很有帮助，能够提高其准确性。
如果治疗之后还是不行可以用精子库精子。精子畸形率达到98，这个是比较高的，严重影响男性正常的生育能力。首先要及时查找原因，比如是否存在精索静脉曲张、慢性前列腺炎、睾丸鞘膜积液等疾病。
按照WhO第五版的标准，要求正常的精子浓度大于1500万，前项运动精子百分比大于32%，正常精子形态率大于4%，精子总数大于3900万，精液量大于1.5毫升，精液的液化时间小于60分钟。除了最基本的精液常规指标，建议同时复查低渗肿胀试验，明确存活精子质量，存活精子大于58%，精子DNA碎片指数小于15%为正常。
