用碘131治疗甲亢的副作用一般可分为早期毒性反应和晚期并发症两种。早期毒性反应是指在两周内出现的反应，晚期并发症是指在两周后出现的并发症，常见的是消化系统的反应，如厌食、恶心、呕吐等，此外，尚有乏力、头晕，少数病人有皮肤搔痒及皮疹等，经对症处理和休息后可以消失。
可以通过药物、手术等方式治疗甲亢突眼症。
对于突眼的药物治疗，可以选择强的松等皮质激素，但作用缓慢，病程长，副作用也多。还有一些其它的免疫抑制剂，比如环磷酰氨，也可以起到一定的效果，不过副作用会比较大。除此之外，云克治疗也可以用来改善突眼的症状，但是效果并不是很好。对严重的突眼症可以通过外科手术来进行治疗，但其效果并不明确。对于突眼症较严重的患者，可以采取其它的治疗措施，以减轻眼窝内的压迫，并配合换血疗法。
用中医治疗甲亢可以通过药物治疗来改善。
中医理论上说，甲状腺功能亢进与肝郁气滞、气郁化火有关系，肝郁气滞、气郁化火，这就是因为肝郁气滞、气郁化火，火旺会消耗气阴，造成阴虚火旺、气阴两虚之证，并伴有血瘀痰浊。在甲亢前期，主要表现为痰气交阻、瘀而化火，临床上可用消肿散、平亢等药物配合使用。在中期，主要表现在痰、血、瘀、消痈散、血府逐瘀汤等方面。在治疗的过程中，如果患者的身体状况会有气阴两虚、肝血不足等情况，可以选择益气养阴、补虚。如果是桥本氏症，那么可以通过白芍、藤类药等药物来进行调理，因为病人自身的抗体比较高。
中医治疗甲亢病通常是采用理气舒郁、化痰消炎等方法。
甲亢在中医学中属于“瘿症”的范畴。中医上一般分为肝郁气滞、肝郁化火、气滞痰凝、气阴两虚等类型。因此，需要进行辨证治疗。中医治疗甲亢讲究的是理气舒郁，化痰消炎，痰结血瘀的治疗以理气活血、化痰消炎为主，而肝火旺盛型则以清肝泻火为主，而心肝阴虚型则以滋阴养精，宁心柔肝为主。
一般情况下，治疗甲亢的好方法有药物治疗、放射性碘131治疗、日常护理等。具体内容如下：
1.药物治疗：如果患者存在甲亢的情况，可以及时前往正规医院，在医生指导下使用甲硫氧嘧啶片、丙硫氧嘧啶片、卡比马唑片等药物进行治疗。
2.放射性碘131治疗：患者还可以在正规医院接受放射性碘131治疗。
3.日常护理：患者还应注意休息，不要过度劳累。
