胆囊结石且胆囊萎缩应该手术治疗，因为胆囊结石的癌变率大概10%，当胆囊出现萎缩的时候，说明胆囊的功能就不健全了。这时候胆囊既然没有功能，里面又有大量的结石，这样引起癌变几率比较大。
胆囊里的结石病并不会自己消失，只会越来越大、数量越来越多，它往往都是由于不规律的生活以及饮食上的习惯造成的。胆囊结石患者一定要及时的去正规医院检查，如果胆囊结石小于五毫米以下并且没有特殊的症状，可以采取保守的治疗，比如药物溶解治疗。
采取非手术措施控制急性炎症期。症状缓解后，可选择手术。内窥镜手术创伤小，疼痛小，适用于下胆总管结石数量少，直径小。如果持续半小时，腹部用胀痛感，可以考虑为胆囊结石引起的，可以进行彩超检查，有疼痛感，可以口服利胆消炎的药物调理的，也可以采取中药调理。在治疗期间，不可以吃刺激性、油腻的食物的慑入。
主要是通过临床上的一些影像学检查来看大小的，一般胆囊结石小于一厘米就算是比较小的了，如果结石的直径大于三厘米，并且还伴有一些胆囊息肉出现，在临床上就是非常大的结石了。
产妇胆囊结石通常可以使用药物来治疗，在产后行手术。
如果怀孕时有胆囊结石，通常不能做胆囊切除手术，因为胆囊切除术是要做全身麻醉的手术，这样会对怀孕产生一定的影响。建议在产妇在生产后再进行外科手术。如果怀孕期间因胆囊结石而出现胆囊炎，可应用抗生素或利胆的药物来控制感染，如感染持续时间过长，且已临近产期，则应在取出胎儿后进行胆囊切除，以控制病情发展。
