治疗精子畸形可以考虑服用药物，改变生活习惯，减少有毒有害物质接触。要调整生活习惯，每天充足的休息，不能熬夜，忌掉抽烟喝酒以及远离辐射环境。平时加强体育锻炼，增强身体免疫力，可以使精子畸形得到改善。
可能是检查的结果不准确或是对方体内的精子活力比较小，但是还是会有部分成熟的优质的精子的，这样才可以怀孕的只要女性选择在排卵期同房，成熟的精子和卵子就可以结合，从而引起怀孕，也很常见，怀孕以后女性可以多注意休息就可以。
生殖道感染引起的畸形精子高，可针对进行抗炎治疗。便秘异常引起的畸形精子高，可给予中西医药物调理。精索静脉曲张引起的精子高畸形，采用显微镜下精索静脉睾丸结扎术。畸形精子如果超过70%，应进行染色体检查。以上内容仅供参考，具体用药、治疗请以医生面诊指导为准。
精子质量不好可能会影响怀孕，一般低于60％就会有影响，现在精子活动率低下可能怀孕几率比较小。去医院系统的检查，查找原因再对症用药治疗，要戒烟戒酒，注意休息，加强营养，不要熬夜。
精子活力低怀孕了胎儿不一定能要，需根据个人情况判断。
若是正常精子与卵子结合形成受精卵，怀孕后可继续妊娠。但若是活力低的精子与卵子结合怀孕，孕期胎儿存在发育不良、流产的风险。所以怀孕早期要定期入院做相关产检，查看胎儿发育情况。若一切正常，无需特殊处理。若出现胚胎发育不良、畸形等情况，可能需要终止妊娠。孕期应加强营养补充，多吃含有叶酸、蛋白质等营养成分的食物，对胎儿发育有益。
精子畸形率96%算是比较高的，能够怀孕成功，非常幸运。怀孕成功之后，如果没有流产迹象没有什么影响，如果出现流产迹象，可能是畸形精子受精，可能会影响胎儿的发育。精子畸形率96%，有4%的精子是正常的，如果是正常精子受精成功，可以形成正常的胚胎。如果是96%的畸形精子受精成功，流产的概率就比较大。注意观察有没有腹痛流血。
