通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
目前的情况是检查发现颅内囊肿，进一步完善相关检查。颅内囊肿是良性病变。由于囊肿生长部位不同，引起的症状也不相同。如果囊肿较小，可以暂时观察，定期复查就可以了。否则，需要手术治疗或者药物治疗。
眉毛中出现的囊肿通常是良性的。如果出现时间较短且囊肿较小，则可以继续观察而无需特殊干预。如果囊肿很大或在短时间内增加，则需要除去治疗。对于可以治疗的囊肿没有特定的药物。眉毛的面积对脸部是有害的，因此它不会太大而不能早期移除。
腰酸，小腹坠胀症状。囊肿长的比较大，会有腹痛症状，用手可以摸到腹部肿物，出现蒂扭转，出现剧烈腹痛，出现生命危险。卵巢囊肿是指卵巢上长了囊性的肿物，有各种不同的性质和形态，可以是一侧卵巢也可以是双侧卵巢都有，囊性肿瘤多属于良性，但是要定期复查，防止恶变。
手腱鞘囊肿可以用手指捏碎，然后挤压成腱鞘囊肿，让其自行吸收。还可以用针管将囊腔内的液体抽出来，然后按压、取出，然后注入肾上腺皮质激素进行包扎。
但与关节腔相连的囊肿不易被穿刺，且一旦被穿刺，很可能再次出现。腱鞘囊肿的发病与腱鞘长期劳损之后，肌腱鞘出现了薄弱环节，而滑膜腔中的滑液柱穿过肌腱的薄弱点，形成囊肿有关。因此在日常生活中出现腱鞘囊肿时要加强局部的保护，纠正不良的姿势，可以进行按摩、温敷等，促进肌腱鞘的愈合。
手上长腱鞘囊肿可以使用以下办法，具体分析如下：
对于小的腱鞘囊肿，要注意不能运动挤压、受刺激，要限制手指的活动，如果有剧烈的疼痛和关节活动，可以用小针刀刺破囊流出。治疗后手指经常活动，容易引起囊肿的复发。大的囊肿要做外科手术，反复出现的腱鞘囊肿囊壁增厚，用小针刀无法有效的治疗，可以通过外科手术将囊肿完全切除，避免复发。
