需要三个月左右才能治好。巧克力囊肿是子宫囊肿的一种，属于良性病变，会伴随有增生、转移、复发等情况的出现，而且会造成痛经、月经失调等，因此建议还是及早治疗比较好，需要服药三个月左右进行巩固治疗，另外需要随时复查。
去专业正规的医院进行检查和治疗，遵医嘱用药。尽量吃清淡一点，要忌生冷和茶。个人的卫生习惯也很重要，内衣勤洗勤换。多用开水烫洗然后放在太阳底下暴晒。保证良好的作息，不要太晚睡觉。
采用腹腔镜微创手术，灭活异位的子宫内膜，微创手术，创伤小，清除和灭活异位内膜病灶更全面。通过药消灭物微小的异位病灶，使之快速凋亡，并调控激素水平，避免子宫内膜异位症死灰复燃。
闭经后囊肿可以缩小，但不会好，停药后又会生长。一般巧克力囊肿和来月经就有一定的关系等不来月经的巧克力囊肿慢慢会萎缩的。及时进一步检查确诊是否有可能是妇科恶性疾病的情况以便及时做出正确的处理方案。
如果出现了巧克力过敏，并且出现皮疹。配合使用抗过敏药物治疗，需要多喝水，或者是使用高渗葡萄糖促进代谢，如果症状缓解比较慢，可以使用输液治疗，并且可以配合使用能量合剂。
巧克力卵巢囊肿可采用的腹腔镜微创术治疗卵巢囊肿卵，手术治疗包括腹腔镜手术和开腹手术，可行囊肿剥离术加卵巢成形术，不需要生育的，行半保守手术，即全子宫切除加患侧附件切除术。
