临床上，如果患上抑郁症和失眠，可以服用褪黑素。
但是服用褪黑素的主要治疗作用是改善抑郁症患者的睡眠状态。对于抑郁症的核心症状（如抑郁症、缺乏兴趣、思维延迟、意志活动减退等）没有改善作用。褪黑素只能缓解失眠，不能完全改善抑郁症的病情。因此，对抑郁症失眠患者来说，首先要确诊系统的抗抑郁治疗。特别是用于抗抑郁治疗的药物推荐使用血清素再摄取抑制剂类。这种药物主要是改善患者的神经递质，如血清素、肾上腺素的清除，从而改善抑郁症症状，从而有效改善患者的各种情绪等。
褪黑素可以改善睡眠，通过缩短睡前觉醒时间和睡眠时间来改善睡眠质量。
睡眠中觉醒次数明显减少，缩短浅睡时间，延长深睡时间会加深睡眠变重，第二天早上唤醒阈值下降，时差调节功能更强。具有促进睡眠、调节时差、抗衰老、调节免疫、抗肿瘤等多种生理功能，国内外褪黑素的健康功能包括调节内分泌、保护脑炎病毒感染、感染后死亡率、降低心血管保护作用等，建议褪黑素在医生指导下应用。
失眠吃褪黑素不好，有的人睡眠不好，就额外补充褪黑素，这种做法实际上干扰正常的生理过程，可能最明显的副作用就是性欲降低，长期服用褪黑素，还可能不吃就睡不着了，长期服用褪黑素会导致自身褪黑素的分泌减少，当停服褪黑素时，用进废退的作用就出来了，自身的褪黑素分泌功能很可能就恢复不回来，或只能恢复一部分了，这就形成了依赖。
褪黑素可以治疗部分失眠。
褪黑素是人体松果体分泌的一种激素，具有一定的镇静、安眠作用，主要作用于视交叉上核，通过激活褪黑素受体调节睡眠，可以改善时差变化造成的失眠以及睡眠时相延迟和昼夜节律失调引起的失眠。随着年龄增长，松果体逐渐萎缩，人体褪黑素含量会逐渐减少，通过补充褪黑素，可以改善睡眠障碍的情况。如果患者存在严重的焦虑、抑郁情绪，在使用褪黑素治疗失眠的同时，需要给予抗焦虑、抑郁的药物进行治疗。
褪黑素产品不具备治疗失眠的功效，但具有诱导和辅助睡眠的作用。
褪黑素被允许作为保健食品的原料，其保健功能仅限于改善睡眠。但在大多数助眠药物中，褪黑素的含量高达3毫克甚至9毫克，远远超过生理需要量，会使人第二天起床后感到头晕。服用褪黑素产生的作用也是逐渐衰减的，对睡眠质量差、早醒、易醒和睡眠时间短等问题的帮助不大，功效不及安眠类药物，更不能替代药物治疗失眠。
失眠吃褪黑素有用的。
这是因为褪黑素是人体中本来就存在的生理性激素，它的分泌和人体的昼夜节律有直接关系，能够改善睡眠质量，使睡眠中觉醒的次数减少，延长深睡眠的阶段。而松果体分泌的褪黑素能调节人体的昼夜节律，使机体感觉到昼夜节律性，白天由于有阳光的作用，体内产生的褪黑素量较少，处于活跃状态，夜间进入睡眠状态时，其分泌的褪黑素较少，因此每天睡眠时间较少。
