卵巢囊肿的病因并不是很清楚，可能有多方面的原因，有的是先天性的，有的与内分泌有关系等。另外，对于卵巢囊肿的治疗，药物治疗是没有作用，除非是手术治疗，但大多数很小的囊肿不需要治疗。不知道病人的囊肿大小，若是囊肿小于5cm，定期复查就可以。
如果由于炎症引起的卵巢囊肿，再抗炎治疗，以后大部分都会消下去的，就是如何判断这个卵巢囊肿，很难判断，所以说，如果有卵巢囊肿，在月经干净3到5天做b超，如果有，并且持续三个月，卵巢囊肿直径大于三公分，可以手术治疗。
诱发因素主要有遗传因素，内分泌因素：卵巢是排卵、分泌性腺激素的重要器官，卵巢肿瘤多发生于生育年龄；生活方式因素长期的饮食结构、生活习惯不好、心理压力过大以及环境因素。
妊娠发现卵巢囊肿，它的治疗要视孕期迟早而定、包块的尺寸及属性，及病人是否有病症。
早孕期间囊肿嵌在盆腔内，可导致流产，中期妊娠易合并蒂扭转，晚期妊娠，如果肿瘤很大就会引起胎位异常，分娩时会导致肿瘤破裂，如果肿瘤位置偏低，会梗阻产道，造成难产。
早孕并发卵巢囊肿，如在怀孕早期，卵巢囊肿直径在6厘米以下，可多为妊娠所致生理性囊肿，这类通常可在不治疗的情况下自然消退。如果囊肿一直延续到孕中期，未见萎缩，但亦不会增加，亦可在产后再行治疗。如果卵巢囊肿呈扩大趋势，或对恶性可能有较高疑虑者立即手术治疗。若妊娠期卵巢囊肿蒂扭转，还需马上做手术。
目前还没有专门的理论来解释卵巢囊肿的原因，但一般和遗传因素以及个体因素有关。
1、遗传因素：女性或外祖母患有卵巢囊肿的后代更容易得卵巢囊肿；
2、个体因素：正常发育时出现的良性囊性肿瘤，比如卵巢畸胎瘤。所有的患者都有不同的原因。
女性在做卵巢囊肿的时候，可以主观的触摸到附件区囊性肿物或者是包块。通过B超、彩超等检查，可以明确腹前区是否有囊性肿块，具体的可以通过磁共振和CT检查来明确。
