如果是脑干损伤导致的，严重的昏迷不醒，那么病情是特别严重的，绝大部分病人都是难以生存下来，要在当地的三级甲等公立医院神经外科，住院治疗，病情稳定以后，尽快做高压氧康复针灸康复和物理康复治疗。
通常情况下，小儿脑干胶质瘤发病没有明显的病原，其本质均属胶质瘤，以星形细胞瘤和多形胶质母细胞瘤为主，少数是以节状胶质瘤及室管膜瘤为主，在脑干上段以低度或恶性星形细胞瘤为主，而在脑干下段，以胶质母细胞瘤为主。大部分的脑干胶质瘤发生在中脑延髓区，边缘清晰，无浸润，无水肿，病理上可分为毛细胞性、纤维性星型、或少见的节状胶质瘤。局部脑干胶质瘤多见于桥脑区，利用MRI进行神经导航和神经电生理学的监控，可以有效地减少病人的神经功能损失。
脑干海绵状血管瘤是可以治好的。直接用手术来切除脑干海绵状血管瘤，是可以达到治愈标准。伽玛刀治疗脑干海绵状血管瘤，它的原理也是跟一般的血管畸形原理是一样的，它是让血管发生闭塞，然后达到以后不出血，就是达到血管闭塞目的，防止以后再出血。如果体积、面积过大或者出血量过大的病人，治疗的时候是有一定风险的。
脑干肿瘤，包括良性的肿瘤和恶性的肿瘤。治疗方式主要包括外科手术治疗以及放化疗的治疗。可根据肿瘤的位置，看看是否需要采取手术治疗，如果不能够进行手术，可以采取使用药物进行外界干预，避免精神紧张，调整好心态，树立战胜疾病的信心。
脑干出现梗死，一般就是考虑后循环的血管出现动脉硬化性脑梗死。脑干出现腔梗一般是比较严重的，因为生命中枢都是在集中在脑干部位，如果梗死的部位在生命中枢，意识，脉搏，呼吸，血压受到影响，就会危及生命。
