巧克力囊肿做B超可以检查出来，但是不能确诊的，只不过单纯的显影有囊肿但是，具体不知道是哪一类的，需要做手术，将组织做病理，才能确诊巧克力囊肿如果已经确诊了，而且直径超过了3cm，就要考虑是否采取手术了，因为保守治疗已经不能治疗好了，甚至还会导致了囊肿的破裂，还是采取手术方法更好的促进卵巢组织健康。
痛经：这是巧克力囊肿的主要症状，为继发性且逐年加重，但也有少数病人无明显的痛经。性生活痛：子宫直肠窝阴道后穹隆，宫骶韧带等部位的子宫内膜异位症均可发生性生活痛，而且常于月经前较为明显；月经不调：月经过多，月经血量多，也是巧克力囊肿临床常见症状之一；腹膜炎；不孕：多数子宫内膜异位症病人伴有不孕症。
巧克力囊肿良性和恶性只能通过病理确定，卵巢的良恶性肿瘤判断是比较复杂的，要结合B超，肿瘤标记物检查，血检查等判断，一般良性肿瘤边界是清楚的，质地是比较均匀的，恶性肿瘤可能会伴有腹水，边界不清楚，具体的要去医院咨询专业医生做相关检查判断的。
子宫腺肌病和子宫肌瘤病变所在部位都是子宫肌层，但是形成病变的组织是完全不同的，子宫腺肌病是子宫内膜腺体及间质侵入子宫肌层形成的病变，而子宫肌瘤主要是由子宫平滑肌细胞增生。
巧克力囊肿是子宫内膜异位到卵巢内周期性出血形成的，一般没有良恶性之分。但是巧克力囊肿是会有发生破解以及恶变的可能，所以及早发现，尽早治疗。必要时，需通过手术切除治疗。
