对于肾萎缩的治疗，应以微化中药渗透治疗为主，西医对症治疗为辅。阻断肾脏纤维化，促进受损组织细胞修复及再生。肾脏萎缩是体积缩小相应肾功能减退，主要是由于慢性肾脏疾病导致肾小球受损。
出现双肾萎缩的病人一般都已经进入到慢性肾功能不全的失代偿期，会做一些针对慢性肾功能不全的非透析疗法，如果血肌酐进一步升高，出现一些由于肌酐高引起的消化道症状，恶心、呕吐等症状以后，给用一些纠正酸中毒以及排毒的药物。
双肾萎缩是不能治好的，但是可以缓解，也可以长期维持基本功能，像正常人一样生活，直到老死。平时避免受凉劳累，调节情绪，疏导心理压力，规律起居饮食，积极适当运动，少吃辛辣刺激，多喝温热蔬菜汤。
双肾萎缩一般见于慢性肾炎，高血压肾损害这些疾病导致的肾脏损伤，一般在出现双肾萎缩的时候，肾功能受损明显，会出现肌酐，尿素的升高以及高血压，临床上可以表现为水肿，夜尿增多，以及因为毒素升高而导致的恶心呕吐，皮肤瘙痒。肾脏对水分的清除能力下降，会出现水钠潴留，出现水肿胸闷，呼吸困难这些症状。
已经缩小的部分是不能恢复的，治疗病因来延缓肾萎缩，常见的原因是慢性肾小球肾炎，早期的慢性肾小球肾炎，往往需要使用激素或者是激素联合免疫抑制剂治疗。如果是糖尿病肾病，需要控制血糖。如果是高血压肾病，需要控制血压。如果是泌尿系统结石引起的问题，需要可能需要手术祛除结石。
双侧肾脏萎缩，往往提示慢性的肾功能衰竭。因为随着疾病时间的延长，肾脏逐渐出现了萎缩，最终会导致肾功能衰竭。出现肾功能衰竭以后，患者存活的时间因人而异。并不是双肾萎缩以后，患者可能就会在短期内死亡。有的患者可能存活的时间比较长，因为如果出现了肾衰竭尿毒症以后，可以通过透析的手段来延长患者的生命。一般来说，存活的时间平均在10年以上。
