乙脑灭活疫苗与减毒疫苗有很大的不同之处，就是因为乙脑灭活疫苗是由死病毒制作而成，副作用比较小，要经过多次的注射，才能在婴儿体内产生抗体。
反复的注射会使婴儿的疼痛和副作用的发生率提高。乙脑减毒疫苗是一种活疫苗，有一定的免疫排斥作用，副作用比较大，但是免疫效果好，接种次数少，对孩子的危害小，更容易为父母所接受。所以，乙脑减毒疫苗优于减毒疫苗。
乙脑疫苗包括乙脑减毒活疫苗和乙脑灭活疫苗两种，两种疫苗的接种时间是有区别的。首先是乙脑灭活疫苗是国家规定基础免疫共注射两针，出生后满6个月的婴儿，开始接种第一针，7到10天后接种第二针，一岁半到两岁左右，以及四岁的时候，各加强一针，六岁的时候再加强一针。其次是乙脑减毒活疫苗是1岁的时候接种第一针，2岁时加强免疫一针，7岁时再加强免疫一针。
儿童接种乙脑疫苗后，是比较容易发热的。疫苗属于人工自动免疫抑制剂，这对于宝宝来说，是一种外来物质，会激发宝宝的免疫系统而出现身体的发热。这种热不会超过38度，不会有明显的不适症状，短期以内就会消失，也可以采取物理降温的方式去控制体温。
乙脑疫苗分为灭活疫苗和减毒活疫苗两类。灭活疫苗，少数人可能出现一过性发热反应，也可出现红肿或皮疹现象，但大多症状较轻不需特殊处理，两天内可自行缓解，对个别出现严重过敏反应的，应及时采取针对措施。减毒活疫苗注射后一般无反应，少数人局部红肿，偶有发热或过敏性皮疹，一般不需特殊处理。
乙脑的症状，主要包括潜伏期的症状、初期的症状、极期的症状以及恢复期的症状。潜伏期大约为2-3周，没有很典型的症状。在初期，大约3-5天，主要表现为发热、头疼、呕吐、呼吸道症状。
打预防针之后的当天晚上或者1-2天后会有些低热现象，有时甚至演变成为发烧、感冒。这是疫苗在体内与机体的免疫系统发生作用，产生的不良反应。发热体温在38.5℃以下，持续1-2天，身体的抗病能力会下降，要多喂水、注意多休息。
